More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1061 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  100 
 
 		 594 aa  1206    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  45.66 
 
 		 618 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.57 
 
 		 603 aa  339  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 608 aa  323  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  32.22 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 624 aa  273  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  35.47 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  33.76 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  31.74 
 
 		 622 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.46 
 
 		 594 aa  257  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  34.78 
 
 		 606 aa  257  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 596 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  31.05 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  34.85 
 
 		 611 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  43.78 
 
 		 626 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  27.12 
 
 		 604 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.43 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.62 
 
 		 593 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  33.42 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  29.51 
 
 		 625 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 423 aa  210  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  30.57 
 
 		 623 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.58 
 
 		 618 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  33.41 
 
 		 618 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.58 
 
 		 618 aa  207  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  30.09 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  33.17 
 
 		 619 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  33.02 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  26.82 
 
 		 604 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  33.08 
 
 		 615 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  29.75 
 
 		 614 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  32.43 
 
 		 597 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30.12 
 
 		 613 aa  196  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  36.39 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.83 
 
 		 587 aa  193  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  29.84 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  26.36 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  29.45 
 
 		 621 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  29.67 
 
 		 621 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  29.45 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.86 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  28.07 
 
 		 626 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  31.7 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.17 
 
 		 593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  26.08 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 616 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 608 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  28.76 
 
 		 638 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  29.68 
 
 		 623 aa  180  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.89 
 
 		 611 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.9 
 
 		 605 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.45 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.84 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  33.55 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  29.93 
 
 		 625 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.11 
 
 		 595 aa  177  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  29.8 
 
 		 619 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  27.93 
 
 		 608 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  31.3 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.34 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.58 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  29.31 
 
 		 653 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.92 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  31.66 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.92 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.92 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  24.96 
 
 		 590 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  25.44 
 
 		 626 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  28.39 
 
 		 631 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.86 
 
 		 628 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.16 
 
 		 1018 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.2 
 
 		 578 aa  170  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  30.15 
 
 		 618 aa  170  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.2 
 
 		 578 aa  170  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  27.79 
 
 		 611 aa  170  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 593 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  29.64 
 
 		 617 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.22 
 
 		 594 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.16 
 
 		 1018 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 		 578 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.63 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  34.18 
 
 		 626 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 590 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.03 
 
 		 594 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  27.27 
 
 		 595 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.07 
 
 		 594 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.2 
 
 		 593 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>