More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01541 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1083    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  32.07 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  30.76 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  33.58 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  31.63 
 
 		 599 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  27.36 
 
 		 600 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.39 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  32 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.1 
 
 		 599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  28.08 
 
 		 625 aa  253  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  27.1 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  26.35 
 
 		 596 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  26.35 
 
 		 596 aa  246  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  25.97 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  28.44 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  27.12 
 
 		 628 aa  239  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  28.49 
 
 		 583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  27.24 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 611 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  29.64 
 
 		 614 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  30.63 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  27.5 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  24.91 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.39 
 
 		 603 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  29.57 
 
 		 612 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  26.43 
 
 		 568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  25.87 
 
 		 599 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  26.28 
 
 		 605 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  27.56 
 
 		 610 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.93 
 
 		 564 aa  209  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  29.67 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.31 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  29.25 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.93 
 
 		 564 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  26.04 
 
 		 610 aa  197  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  27.49 
 
 		 603 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  26.22 
 
 		 601 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  28.75 
 
 		 613 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  29.14 
 
 		 626 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.91 
 
 		 601 aa  191  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  26.16 
 
 		 585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  25.89 
 
 		 607 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  33.15 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  31.06 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.92 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  27.36 
 
 		 569 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  24.1 
 
 		 606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.53 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.6 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  26.18 
 
 		 566 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  26.42 
 
 		 588 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.46 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  27.65 
 
 		 592 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.61 
 
 		 581 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.39 
 
 		 597 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  26.23 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  37.85 
 
 		 594 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  34.25 
 
 		 597 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  32.56 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.16 
 
 		 573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  26.74 
 
 		 586 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.65 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  27.7 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  37.5 
 
 		 1042 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  29.6 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  24.62 
 
 		 585 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  37.32 
 
 		 699 aa  164  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  33.98 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  26.12 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  42.98 
 
 		 588 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  40.96 
 
 		 596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  27.24 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.07 
 
 		 590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  37.71 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  29.49 
 
 		 586 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.01 
 
 		 610 aa  163  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  29.23 
 
 		 556 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 594 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.78 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  37.25 
 
 		 587 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.24 
 
 		 567 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.84 
 
 		 727 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  27.56 
 
 		 585 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  42.53 
 
 		 596 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  35.42 
 
 		 980 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  39.48 
 
 		 1038 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  39.48 
 
 		 1038 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  31.66 
 
 		 590 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.06 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  35.6 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  39.17 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  38.46 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.49 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  34.54 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.7 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.06 
 
 		 601 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  28.24 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  25.86 
 
 		 618 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.9 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>