More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1250 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.96 
 
 		 564 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  67.14 
 
 		 564 aa  741    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.96 
 
 		 564 aa  739    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  100 
 
 		 564 aa  1118    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  29.34 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  30.98 
 
 		 594 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  32.23 
 
 		 614 aa  294  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  29.98 
 
 		 611 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  28.65 
 
 		 605 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.22 
 
 		 600 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  29.95 
 
 		 628 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  26.94 
 
 		 625 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 599 aa  273  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  29.39 
 
 		 603 aa  273  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.57 
 
 		 610 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  30.41 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 599 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  29.7 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  33.27 
 
 		 599 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  29.31 
 
 		 583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  26.49 
 
 		 596 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  28.37 
 
 		 585 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  27.26 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  26.62 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.26 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  26.3 
 
 		 613 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  28.1 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.14 
 
 		 594 aa  230  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  27.32 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.34 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 		 601 aa  227  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.72 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  28.7 
 
 		 676 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.08 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  30.46 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.2 
 
 		 607 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  29.57 
 
 		 610 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.36 
 
 		 612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  29.25 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.13 
 
 		 590 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  28.55 
 
 		 599 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  30.31 
 
 		 603 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  30.14 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.71 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  30.26 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  29.4 
 
 		 552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.2 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  29.89 
 
 		 613 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  28.04 
 
 		 610 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.29 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44710  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.34 
 
 		 596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  28.97 
 
 		 606 aa  213  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.2 
 
 		 721 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.1 
 
 		 597 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  27.15 
 
 		 600 aa  211  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  29.12 
 
 		 603 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.93 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.29 
 
 		 587 aa  209  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.94 
 
 		 575 aa  209  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  27.91 
 
 		 611 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.36 
 
 		 597 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.96 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  27.74 
 
 		 611 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  28.27 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.22 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.82 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.82 
 
 		 574 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.82 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.82 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.82 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.82 
 
 		 574 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.82 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.26 
 
 		 586 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.22 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.98 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.82 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.79 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.6 
 
 		 592 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.79 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.72 
 
 		 586 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.98 
 
 		 603 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.91 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1010  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.49 
 
 		 629 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  26.32 
 
 		 612 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  28.37 
 
 		 634 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.51 
 
 		 583 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  27.34 
 
 		 586 aa  204  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  27.61 
 
 		 592 aa  204  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.3 
 
 		 602 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  28.26 
 
 		 632 aa  203  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.77 
 
 		 602 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.18 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  31.88 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.8 
 
 		 593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  28.71 
 
 		 586 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.99 
 
 		 613 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.68 
 
 		 575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.6 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.15 
 
 		 610 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  29.98 
 
 		 639 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>