More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0425 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  100 
 
 		 721 aa  1461    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  52.82 
 
 		 759 aa  775    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.13 
 
 		 738 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  41.88 
 
 		 734 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  43.08 
 
 		 717 aa  576  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  41.6 
 
 		 734 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  40.47 
 
 		 727 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  38.09 
 
 		 727 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  38.42 
 
 		 739 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  38.18 
 
 		 760 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  36.63 
 
 		 716 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  36.06 
 
 		 747 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  34.64 
 
 		 722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  37.15 
 
 		 721 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  36.22 
 
 		 716 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.81 
 
 		 1013 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  34.66 
 
 		 906 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 		 1038 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  34.66 
 
 		 906 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.8 
 
 		 908 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  34.81 
 
 		 738 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.64 
 
 		 1019 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.26 
 
 		 1040 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.95 
 
 		 908 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.09 
 
 		 1011 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  32.15 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  32.21 
 
 		 1042 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.49 
 
 		 1018 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.21 
 
 		 1018 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.21 
 
 		 1018 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.19 
 
 		 1008 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.19 
 
 		 1008 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  31.33 
 
 		 724 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  31.33 
 
 		 724 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.47 
 
 		 865 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  36.73 
 
 		 699 aa  379  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.98 
 
 		 1024 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  37.06 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.27 
 
 		 1003 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.73 
 
 		 720 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.22 
 
 		 892 aa  365  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.21 
 
 		 743 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.73 
 
 		 731 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  31.51 
 
 		 986 aa  359  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.34 
 
 		 726 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.74 
 
 		 720 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.14 
 
 		 1013 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 1000 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  41.84 
 
 		 455 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  32.27 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.08 
 
 		 725 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  32.85 
 
 		 743 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.11 
 
 		 1001 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 726 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.97 
 
 		 726 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  30.15 
 
 		 716 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.25 
 
 		 728 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.59 
 
 		 721 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.68 
 
 		 728 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  31.82 
 
 		 706 aa  345  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.69 
 
 		 725 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.64 
 
 		 705 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.25 
 
 		 722 aa  344  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  28.63 
 
 		 721 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  29.13 
 
 		 736 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.19 
 
 		 1012 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  33.82 
 
 		 930 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.47 
 
 		 999 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  31.44 
 
 		 750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32 
 
 		 720 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.35 
 
 		 980 aa  337  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.92 
 
 		 1016 aa  336  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.14 
 
 		 741 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  31.16 
 
 		 724 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 720 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.86 
 
 		 975 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  30.06 
 
 		 715 aa  332  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.83 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  28.53 
 
 		 722 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  31.02 
 
 		 724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  31.41 
 
 		 730 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.99 
 
 		 739 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.76 
 
 		 721 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  37.36 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  29.62 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  29.35 
 
 		 725 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  30.47 
 
 		 753 aa  326  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  30.41 
 
 		 1717 aa  326  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.33 
 
 		 971 aa  325  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  34.49 
 
 		 720 aa  324  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  29.79 
 
 		 738 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  31.64 
 
 		 968 aa  323  7e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.7 
 
 		 726 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  30.49 
 
 		 714 aa  320  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.84 
 
 		 741 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.57 
 
 		 976 aa  320  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  44.12 
 
 		 521 aa  319  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  29.64 
 
 		 734 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  28.63 
 
 		 740 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>