More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1272 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 564 aa  1118    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  98.4 
 
 		 564 aa  1102    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  67.14 
 
 		 564 aa  775    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  98.23 
 
 		 564 aa  1102    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  32.12 
 
 		 614 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.93 
 
 		 600 aa  299  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  30.99 
 
 		 594 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.5 
 
 		 611 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  28.1 
 
 		 625 aa  280  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  27.98 
 
 		 596 aa  267  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  28.55 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  29.98 
 
 		 600 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.55 
 
 		 603 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  30.05 
 
 		 583 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  28 
 
 		 605 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  27.54 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  29.63 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.9 
 
 		 599 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  30.81 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  27.73 
 
 		 628 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 599 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  27.91 
 
 		 571 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  27.5 
 
 		 585 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  27.96 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  28.3 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.97 
 
 		 599 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  27.34 
 
 		 613 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.08 
 
 		 556 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  26.84 
 
 		 606 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.99 
 
 		 587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  28.98 
 
 		 603 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  33.23 
 
 		 610 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  30.15 
 
 		 613 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.09 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  29.15 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.41 
 
 		 573 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 		 600 aa  211  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.12 
 
 		 601 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  27.89 
 
 		 610 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.55 
 
 		 594 aa  210  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.78 
 
 		 607 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  30.24 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.6 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.29 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28 
 
 		 601 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 578 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  28.77 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  27.84 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.69 
 
 		 575 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.92 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  30.45 
 
 		 676 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  29.65 
 
 		 578 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.55 
 
 		 603 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.68 
 
 		 605 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 611 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.71 
 
 		 594 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.99 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  28.08 
 
 		 603 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.99 
 
 		 574 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  28.31 
 
 		 552 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.43 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  33.33 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.93 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.74 
 
 		 612 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  30.48 
 
 		 597 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.87 
 
 		 586 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.29 
 
 		 590 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.18 
 
 		 578 aa  203  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.18 
 
 		 578 aa  203  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  40.5 
 
 		 613 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  32.76 
 
 		 613 aa  203  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  26.8 
 
 		 599 aa  203  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.52 
 
 		 580 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.52 
 
 		 580 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  27.66 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.3 
 
 		 586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.15 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  27.2 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.53 
 
 		 759 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 		 592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  30.06 
 
 		 586 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  36.43 
 
 		 589 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.56 
 
 		 578 aa  200  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.46 
 
 		 600 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.96 
 
 		 581 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.82 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  28.93 
 
 		 650 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  33.33 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0580  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.67 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27 
 
 		 583 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.92 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 		 596 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 		 574 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.41 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.41 
 
 		 574 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.41 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 		 596 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>