More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3988 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  100 
 
 		 597 aa  1207    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  39.11 
 
 		 594 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  34.82 
 
 		 599 aa  364  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  37.97 
 
 		 564 aa  353  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  36.77 
 
 		 603 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  34.07 
 
 		 616 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.14 
 
 		 618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.52 
 
 		 595 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  30.57 
 
 		 676 aa  267  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  29.84 
 
 		 602 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 613 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  34.55 
 
 		 600 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  28.83 
 
 		 600 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 598 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.84 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  30.96 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.99 
 
 		 567 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  31.59 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  32.85 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.48 
 
 		 594 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  32.68 
 
 		 609 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.24 
 
 		 627 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  33.96 
 
 		 746 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  35.27 
 
 		 613 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.04 
 
 		 575 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 		 616 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 594 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.97 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  32.22 
 
 		 636 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.1 
 
 		 572 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  32.9 
 
 		 583 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.36 
 
 		 567 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.36 
 
 		 567 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.65 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 577 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  31.85 
 
 		 749 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  32.44 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  29.41 
 
 		 634 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.97 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.08 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.08 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  31.24 
 
 		 649 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.63 
 
 		 596 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.51 
 
 		 585 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.45 
 
 		 582 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.76 
 
 		 593 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.62 
 
 		 612 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 578 aa  226  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  31.03 
 
 		 613 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.86 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  30.72 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 566 aa  224  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.61 
 
 		 598 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.1 
 
 		 571 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.13 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 601 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  34.66 
 
 		 608 aa  223  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.67 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.12 
 
 		 580 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.25 
 
 		 572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.65 
 
 		 586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  32.68 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 622 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  30.8 
 
 		 611 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  31.89 
 
 		 687 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  31.88 
 
 		 614 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.04 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  28.17 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.69 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.69 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.69 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  32.2 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  32.71 
 
 		 600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.01 
 
 		 586 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  31.01 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  29.64 
 
 		 582 aa  220  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.84 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  33.05 
 
 		 597 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.86 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.06 
 
 		 579 aa  220  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.17 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.84 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.34 
 
 		 595 aa  220  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 592 aa  220  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  34.57 
 
 		 589 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 571 aa  220  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.67 
 
 		 586 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 642 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.15 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.1 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.65 
 
 		 613 aa  219  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  32.88 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.94 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.78 
 
 		 611 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.78 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>