More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3270 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  100 
 
 		 594 aa  1195    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  39.26 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  39.11 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  33.27 
 
 		 618 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.76 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  31.92 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  31.42 
 
 		 603 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  30.38 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  31.07 
 
 		 676 aa  239  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  31.92 
 
 		 564 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  28.74 
 
 		 600 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  35.62 
 
 		 600 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 		 606 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  32.28 
 
 		 749 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  29.6 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  30.32 
 
 		 613 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.42 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.85 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  48.9 
 
 		 595 aa  218  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  43.43 
 
 		 589 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  30.18 
 
 		 574 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  34.94 
 
 		 636 aa  213  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  47.33 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  46.28 
 
 		 605 aa  213  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.96 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.17 
 
 		 582 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 620 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  26.62 
 
 		 600 aa  210  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  30.8 
 
 		 592 aa  209  9e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.61 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  44.77 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  47.35 
 
 		 625 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.63 
 
 		 591 aa  208  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.68 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  30.85 
 
 		 579 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  33.26 
 
 		 595 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.16 
 
 		 611 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  29.76 
 
 		 571 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  46.12 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.45 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.74 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.83 
 
 		 583 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.21 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  31.89 
 
 		 746 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  31.61 
 
 		 613 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.52 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.31 
 
 		 1019 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.24 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.24 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.13 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.24 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  43.43 
 
 		 581 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  45.04 
 
 		 624 aa  204  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  33.91 
 
 		 583 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.45 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  48.02 
 
 		 652 aa  203  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  43.6 
 
 		 594 aa  203  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.11 
 
 		 595 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  33.72 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.26 
 
 		 578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.26 
 
 		 578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  41.98 
 
 		 605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.93 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  44.49 
 
 		 594 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  30.43 
 
 		 603 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 636 aa  201  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  31.51 
 
 		 584 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  28.9 
 
 		 587 aa  200  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.11 
 
 		 603 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.42 
 
 		 595 aa  200  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  29.05 
 
 		 586 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 650 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.88 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  42.17 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  42.5 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.97 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  45.99 
 
 		 579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  46.7 
 
 		 626 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  42.5 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.59 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  33.81 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  43.89 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.42 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  44.68 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  31.61 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>