More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1061 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  54.24 
 
 		 584 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  100 
 
 		 592 aa  1204    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  67.18 
 
 		 585 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  62.39 
 
 		 598 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  57.19 
 
 		 581 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2049  ABC transporter, ATP-binding/permease  61.13 
 
 		 585 aa  723    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  61.6 
 
 		 582 aa  728    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2702  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 588 aa  621  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000694566  normal  0.246929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  54.16 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33.93 
 
 		 603 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.91 
 
 		 625 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  31.77 
 
 		 601 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  30.82 
 
 		 596 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.5 
 
 		 671 aa  259  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  30.08 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.96 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.18 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  32.32 
 
 		 651 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  30.18 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  30.56 
 
 		 660 aa  254  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  28.83 
 
 		 629 aa  251  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  32.28 
 
 		 610 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.93 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  32.1 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 620 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  31.67 
 
 		 622 aa  247  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  31.41 
 
 		 596 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.5 
 
 		 638 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  32.57 
 
 		 617 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  31.09 
 
 		 594 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  31.09 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  29.92 
 
 		 602 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 658 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.04 
 
 		 644 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.22 
 
 		 980 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.4 
 
 		 717 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  29.28 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  37.82 
 
 		 606 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 581 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  29.75 
 
 		 595 aa  240  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.01 
 
 		 1019 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.17 
 
 		 584 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  30.03 
 
 		 623 aa  239  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  29.24 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.67 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.35 
 
 		 1040 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 		 596 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  30.2 
 
 		 650 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.72 
 
 		 1018 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.72 
 
 		 1018 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  29.61 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  30.73 
 
 		 590 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.02 
 
 		 727 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  31.69 
 
 		 598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.13 
 
 		 975 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  32.33 
 
 		 606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  30.86 
 
 		 648 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  31.69 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  31.69 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  27.86 
 
 		 577 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  31.53 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  30.76 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  33.95 
 
 		 1522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 585 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.76 
 
 		 580 aa  234  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  30.68 
 
 		 578 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  28.5 
 
 		 719 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  33.72 
 
 		 595 aa  234  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  28.09 
 
 		 590 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  30.77 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.15 
 
 		 572 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  31.11 
 
 		 610 aa  233  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.71 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.59 
 
 		 1018 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  30.29 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  38.2 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.16 
 
 		 594 aa  233  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.1 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  32.32 
 
 		 920 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  32.44 
 
 		 580 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.54 
 
 		 650 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  27.96 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.02 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.1 
 
 		 584 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  32.91 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  30.44 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  28.62 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 		 602 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  29.39 
 
 		 747 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  30.67 
 
 		 590 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 572 aa  231  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  30.22 
 
 		 590 aa  231  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.87 
 
 		 582 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 586 aa  230  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>