More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7197 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  52.58 
 
 		 582 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  53.83 
 
 		 598 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  65.63 
 
 		 587 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  57.61 
 
 		 585 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2702  ABC transporter related protein  70.4 
 
 		 588 aa  853    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000694566  normal  0.246929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  100 
 
 		 584 aa  1186    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2049  ABC transporter, ATP-binding/permease  53.89 
 
 		 585 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  54.24 
 
 		 592 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  47.94 
 
 		 581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 671 aa  267  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.22 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 639 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  31.27 
 
 		 612 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  31.8 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  30.55 
 
 		 651 aa  246  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  31.11 
 
 		 612 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.61 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.95 
 
 		 768 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.11 
 
 		 638 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  31.22 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.08 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.1 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  30.63 
 
 		 644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.03 
 
 		 976 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  30.83 
 
 		 655 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  32.93 
 
 		 634 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.41 
 
 		 627 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.56 
 
 		 625 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 		 592 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.53 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  31.75 
 
 		 647 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 620 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  32.49 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.29 
 
 		 971 aa  238  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.52 
 
 		 580 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  29.62 
 
 		 603 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  30.94 
 
 		 602 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  31.21 
 
 		 603 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.12 
 
 		 705 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  29.4 
 
 		 782 aa  236  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 650 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  28.97 
 
 		 648 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  29.35 
 
 		 603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.69 
 
 		 577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  30.15 
 
 		 652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.15 
 
 		 738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.11 
 
 		 660 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  31.03 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31 
 
 		 975 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.4 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  31.02 
 
 		 628 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  31.36 
 
 		 655 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2054  ABC transporter related  30.68 
 
 		 619 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  28.15 
 
 		 629 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  29.71 
 
 		 768 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  31.08 
 
 		 596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.03 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  32.73 
 
 		 639 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  29.71 
 
 		 814 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 632 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  30.37 
 
 		 672 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  31.08 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  31.86 
 
 		 648 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  32.94 
 
 		 607 aa  233  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  31.19 
 
 		 750 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.59 
 
 		 644 aa  233  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  31.36 
 
 		 770 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.66 
 
 		 629 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 593 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  31.08 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  36.61 
 
 		 606 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.1 
 
 		 1008 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  34.15 
 
 		 455 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  34.14 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.1 
 
 		 1008 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.33 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.33 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.33 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.02 
 
 		 764 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.33 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.33 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.99 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.94 
 
 		 601 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  32.51 
 
 		 566 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  32.78 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.64 
 
 		 1040 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.75 
 
 		 556 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.93 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.82 
 
 		 571 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  38.34 
 
 		 606 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.49 
 
 		 1018 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.64 
 
 		 586 aa  230  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  33.13 
 
 		 596 aa  230  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  29.85 
 
 		 595 aa  229  8e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  29.55 
 
 		 652 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.68 
 
 		 590 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.94 
 
 		 1001 aa  229  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>