More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7103 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  57.61 
 
 		 584 aa  708    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  67.18 
 
 		 592 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1191    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  62.39 
 
 		 582 aa  754    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  55.73 
 
 		 581 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2702  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 588 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000694566  normal  0.246929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  56.75 
 
 		 587 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  62.52 
 
 		 598 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2049  ABC transporter, ATP-binding/permease  62.91 
 
 		 585 aa  763    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.61 
 
 		 671 aa  283  7.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  31.07 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.37 
 
 		 595 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 620 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  32.07 
 
 		 719 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  29.72 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 650 aa  247  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.63 
 
 		 1018 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  31.15 
 
 		 651 aa  247  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.63 
 
 		 1018 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.87 
 
 		 1040 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  28.74 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.7 
 
 		 571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.37 
 
 		 598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.69 
 
 		 727 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.64 
 
 		 627 aa  243  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.73 
 
 		 1018 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.86 
 
 		 717 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.29 
 
 		 571 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.29 
 
 		 571 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.53 
 
 		 571 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.53 
 
 		 571 aa  243  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 623 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.53 
 
 		 571 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.53 
 
 		 571 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  30.87 
 
 		 672 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.53 
 
 		 571 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  30.08 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.3 
 
 		 591 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 623 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.96 
 
 		 1019 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.19 
 
 		 623 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 623 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.21 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 623 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.54 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 623 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  29.64 
 
 		 596 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.19 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.19 
 
 		 654 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  30.35 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.26 
 
 		 577 aa  240  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.53 
 
 		 571 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  31.66 
 
 		 612 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  28.45 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.02 
 
 		 629 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.86 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.63 
 
 		 644 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  29.73 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  31.32 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.19 
 
 		 651 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  31.73 
 
 		 648 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.05 
 
 		 601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  31.71 
 
 		 630 aa  237  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.1 
 
 		 579 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  30.08 
 
 		 575 aa  236  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  30.05 
 
 		 601 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  28.6 
 
 		 596 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.83 
 
 		 738 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.43 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  30.72 
 
 		 724 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  28.93 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  31.48 
 
 		 727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.98 
 
 		 980 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.48 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  37.63 
 
 		 646 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 592 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  30.16 
 
 		 714 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.31 
 
 		 588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  30.36 
 
 		 714 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.46 
 
 		 604 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.07 
 
 		 582 aa  234  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2054  ABC transporter related  28.74 
 
 		 619 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.17 
 
 		 700 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 		 586 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  30.45 
 
 		 612 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  33.85 
 
 		 606 aa  233  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  28.21 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.29 
 
 		 594 aa  233  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.45 
 
 		 612 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  28.01 
 
 		 590 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  30.86 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.4 
 
 		 595 aa  233  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  30.86 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.38 
 
 		 578 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.39 
 
 		 572 aa  232  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  29.84 
 
 		 738 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  27.73 
 
 		 652 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>