More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1924 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.39 
 
 
626 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.07 
 
 
590 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.32 
 
 
591 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.7 
 
 
590 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.7 
 
 
590 aa  710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.71 
 
 
602 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.86 
 
 
599 aa  705    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.72 
 
 
604 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.71 
 
 
602 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.77 
 
 
595 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  63.64 
 
 
593 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.15 
 
 
600 aa  696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.79 
 
 
596 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.27 
 
 
594 aa  732    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 
599 aa  1201    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  45.94 
 
 
585 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.04 
 
 
597 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.14 
 
 
599 aa  485  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.07 
 
 
595 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.77 
 
 
597 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.4 
 
 
583 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.91 
 
 
587 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.56 
 
 
587 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.65 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.27 
 
 
571 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  36.96 
 
 
672 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
571 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 
571 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 
571 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
571 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  34.4 
 
 
620 aa  300  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 
571 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.79 
 
 
571 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  34.33 
 
 
578 aa  299  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.05 
 
 
597 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.29 
 
 
574 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.29 
 
 
574 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.76 
 
 
582 aa  296  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  37.08 
 
 
672 aa  296  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.89 
 
 
571 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.89 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.02 
 
 
575 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.94 
 
 
597 aa  293  9e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.94 
 
 
597 aa  292  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.83 
 
 
627 aa  292  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
622 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
640 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  34.38 
 
 
655 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  37.18 
 
 
624 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33 
 
 
622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  33.46 
 
 
546 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
598 aa  287  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.68 
 
 
567 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.89 
 
 
567 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.1 
 
 
784 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  34.95 
 
 
626 aa  283  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  38.68 
 
 
640 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  35.66 
 
 
627 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.12 
 
 
587 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35 
 
 
584 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.69 
 
 
768 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.76 
 
 
602 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
642 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  33.13 
 
 
550 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.44 
 
 
764 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  35.22 
 
 
814 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 
592 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  35.22 
 
 
768 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.44 
 
 
576 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.12 
 
 
620 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.62 
 
 
636 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.82 
 
 
579 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
622 aa  281  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.59 
 
 
628 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.33 
 
 
572 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
575 aa  280  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.09 
 
 
598 aa  280  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.84 
 
 
582 aa  280  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  34.96 
 
 
652 aa  279  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.2 
 
 
572 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  36.45 
 
 
618 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.45 
 
 
567 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.2 
 
 
572 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.49 
 
 
617 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  34.1 
 
 
580 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  37.25 
 
 
655 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  35.06 
 
 
580 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  35.56 
 
 
646 aa  278  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.26 
 
 
468 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  36.67 
 
 
628 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.67 
 
 
651 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  34.24 
 
 
808 aa  276  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.46 
 
 
609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.76 
 
 
606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  36.04 
 
 
638 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  34.3 
 
 
777 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  33.91 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  34.86 
 
 
770 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  37.04 
 
 
662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>