More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4829 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  73.91 
 
 		 594 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.7 
 
 		 599 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.48 
 
 		 596 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.7 
 
 		 599 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.81 
 
 		 626 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  99.49 
 
 		 590 aa  1172    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.29 
 
 		 602 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  79.73 
 
 		 591 aa  947    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.17 
 
 		 604 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.22 
 
 		 602 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.52 
 
 		 600 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.19 
 
 		 593 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  95.93 
 
 		 590 aa  1117    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.87 
 
 		 595 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 590 aa  1178    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.65 
 
 		 595 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.13 
 
 		 597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.99 
 
 		 599 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.17 
 
 		 585 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.78 
 
 		 597 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.59 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.08 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.74 
 
 		 583 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.09 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.4 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.43 
 
 		 584 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.57 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 598 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  38.3 
 
 		 567 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.75 
 
 		 571 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.75 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.75 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.75 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.75 
 
 		 571 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.1 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.75 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.69 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.4 
 
 		 576 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.58 
 
 		 571 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  35.23 
 
 		 920 aa  293  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.75 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.43 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.35 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  33.97 
 
 		 572 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 572 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.93 
 
 		 567 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.4 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.09 
 
 		 768 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.92 
 
 		 594 aa  287  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 		 622 aa  287  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  33.5 
 
 		 620 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  34.37 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.92 
 
 		 574 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  34.37 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.37 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.92 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  35.05 
 
 		 778 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.79 
 
 		 587 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.74 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  33.77 
 
 		 672 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 632 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.45 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.01 
 
 		 627 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.39 
 
 		 609 aa  281  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  33.14 
 
 		 609 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  38.43 
 
 		 612 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 591 aa  281  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.65 
 
 		 764 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.98 
 
 		 566 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  33.46 
 
 		 768 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 		 603 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.5 
 
 		 636 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  33.46 
 
 		 814 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  33.52 
 
 		 784 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  38.54 
 
 		 593 aa  280  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  34.13 
 
 		 782 aa  279  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  33.06 
 
 		 592 aa  279  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  35.09 
 
 		 672 aa  279  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.99 
 
 		 606 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.27 
 
 		 603 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.64 
 
 		 627 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.45 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.76 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 620 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  35.61 
 
 		 726 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.52 
 
 		 602 aa  277  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  33.79 
 
 		 784 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.87 
 
 		 610 aa  276  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.2 
 
 		 597 aa  276  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  34.65 
 
 		 770 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  37.45 
 
 		 595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.61 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.25 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  34.65 
 
 		 750 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  33.79 
 
 		 782 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  35.17 
 
 		 568 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  35.43 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.74 
 
 		 628 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>