More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1325 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.4 
 
 		 590 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.34 
 
 		 594 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.66 
 
 		 590 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.1 
 
 		 595 aa  680    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  80.9 
 
 		 626 aa  971    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  82.97 
 
 		 596 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.14 
 
 		 591 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.71 
 
 		 599 aa  735    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  93.17 
 
 		 602 aa  1086    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.52 
 
 		 600 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  85.62 
 
 		 604 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  89.06 
 
 		 599 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 602 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  83.5 
 
 		 593 aa  978    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.4 
 
 		 590 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.44 
 
 		 585 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.5 
 
 		 597 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.45 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.34 
 
 		 599 aa  465  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.88 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.54 
 
 		 587 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.62 
 
 		 597 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.23 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.47 
 
 		 597 aa  302  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.53 
 
 		 609 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  35.69 
 
 		 672 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.37 
 
 		 575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.21 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.81 
 
 		 627 aa  282  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 567 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.51 
 
 		 768 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.11 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  38.33 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.36 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.36 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.36 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.36 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 571 aa  280  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.42 
 
 		 587 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.92 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.92 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  33.51 
 
 		 638 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.24 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 571 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.77 
 
 		 571 aa  278  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.77 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.05 
 
 		 627 aa  277  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.97 
 
 		 582 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.1 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  35.86 
 
 		 782 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 598 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  29.69 
 
 		 587 aa  273  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 		 572 aa  273  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.85 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.89 
 
 		 572 aa  273  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.11 
 
 		 572 aa  273  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  33 
 
 		 578 aa  273  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.89 
 
 		 572 aa  273  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 		 784 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.92 
 
 		 750 aa  273  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 572 aa  273  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  33.88 
 
 		 655 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.92 
 
 		 770 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.52 
 
 		 760 aa  272  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.85 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.44 
 
 		 608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  35.62 
 
 		 784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.36 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  33.78 
 
 		 580 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.48 
 
 		 580 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.18 
 
 		 764 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.98 
 
 		 614 aa  271  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  36.55 
 
 		 640 aa  271  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  34.79 
 
 		 580 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.61 
 
 		 764 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  34.92 
 
 		 651 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  33.4 
 
 		 672 aa  269  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.41 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  31.56 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  32.97 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  34.62 
 
 		 814 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  35.07 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  36.23 
 
 		 778 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.23 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  34.62 
 
 		 768 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  34.1 
 
 		 652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  37.65 
 
 		 612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.71 
 
 		 602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 773 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.64 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  33.39 
 
 		 661 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  35.51 
 
 		 593 aa  267  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  31.83 
 
 		 629 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  35.2 
 
 		 726 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  34.18 
 
 		 651 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>