More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0998 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 599 aa  1224    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.23 
 
 		 585 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  99.33 
 
 		 597 aa  1215    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.14 
 
 		 587 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  93.82 
 
 		 597 aa  1144    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.31 
 
 		 587 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.67 
 
 		 595 aa  793    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.59 
 
 		 583 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.87 
 
 		 599 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.01 
 
 		 596 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.7 
 
 		 594 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.8 
 
 		 604 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.31 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.29 
 
 		 591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.37 
 
 		 600 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.82 
 
 		 599 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.99 
 
 		 626 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.34 
 
 		 602 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.71 
 
 		 593 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.82 
 
 		 602 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.43 
 
 		 590 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.99 
 
 		 590 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.47 
 
 		 590 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.33 
 
 		 597 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  32.94 
 
 		 613 aa  302  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 575 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.39 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.74 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  34.48 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  32.94 
 
 		 584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 598 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.12 
 
 		 594 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.2 
 
 		 584 aa  283  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.29 
 
 		 640 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  30.52 
 
 		 628 aa  282  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.15 
 
 		 617 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.7 
 
 		 608 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.49 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.24 
 
 		 634 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  30.81 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  30.63 
 
 		 626 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  34.4 
 
 		 671 aa  276  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 		 637 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  33.04 
 
 		 603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.02 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.07 
 
 		 593 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  32.08 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  35.02 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  33.28 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.86 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.56 
 
 		 631 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.71 
 
 		 637 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.6 
 
 		 596 aa  274  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  29.57 
 
 		 619 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  31.92 
 
 		 620 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.72 
 
 		 614 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.01 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.98 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.26 
 
 		 578 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.26 
 
 		 578 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  32.29 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.51 
 
 		 619 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.08 
 
 		 650 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.61 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  34.46 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.93 
 
 		 764 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33 
 
 		 1000 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  34.33 
 
 		 631 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.42 
 
 		 579 aa  267  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  34.33 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  33.2 
 
 		 618 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  32.87 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  34.33 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  30.36 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.66 
 
 		 588 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.69 
 
 		 580 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.03 
 
 		 638 aa  266  8e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  32.01 
 
 		 601 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.51 
 
 		 597 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.51 
 
 		 597 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 620 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  31.85 
 
 		 627 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 		 702 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 589 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.69 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  31.84 
 
 		 601 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.99 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.74 
 
 		 672 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  32.77 
 
 		 660 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.84 
 
 		 609 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.78 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 591 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  38.83 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.56 
 
 		 571 aa  265  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  36.56 
 
 		 571 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.56 
 
 		 571 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>