More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1195 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  97.72 
 
 		 603 aa  1064    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  99.47 
 
 		 603 aa  1104    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  82.81 
 
 		 589 aa  863    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  100 
 
 		 569 aa  1107    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  38.06 
 
 		 584 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.45 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.43 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 		 586 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.03 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.03 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.15 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.9 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  38.98 
 
 		 612 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.43 
 
 		 585 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  38.22 
 
 		 584 aa  337  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.85 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.03 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.08 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.91 
 
 		 608 aa  333  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.88 
 
 		 580 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.97 
 
 		 602 aa  330  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.92 
 
 		 578 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.92 
 
 		 578 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.65 
 
 		 597 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  40.86 
 
 		 606 aa  326  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  42.89 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.54 
 
 		 614 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 578 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.35 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.35 
 
 		 594 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.75 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 640 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 598 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.57 
 
 		 622 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  39.08 
 
 		 597 aa  319  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.83 
 
 		 556 aa  319  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.99 
 
 		 578 aa  318  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  38.64 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 1000 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.58 
 
 		 598 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  39.3 
 
 		 582 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 585 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  38.56 
 
 		 610 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.29 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.76 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.99 
 
 		 597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 603 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.17 
 
 		 586 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.8 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.81 
 
 		 577 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.71 
 
 		 575 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.61 
 
 		 609 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.41 
 
 		 578 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.22 
 
 		 572 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.99 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.55 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 991 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  39.47 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  38.76 
 
 		 981 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.52 
 
 		 976 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.92 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  37.17 
 
 		 621 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  41.3 
 
 		 582 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.72 
 
 		 634 aa  309  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.49 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.92 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  38.92 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 		 631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.45 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  40.17 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  36.59 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  36.39 
 
 		 636 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.22 
 
 		 582 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  35.9 
 
 		 596 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  36.46 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.99 
 
 		 598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.39 
 
 		 600 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  37.8 
 
 		 603 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  38.22 
 
 		 607 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.55 
 
 		 595 aa  306  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  39.53 
 
 		 617 aa  306  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.74 
 
 		 587 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.68 
 
 		 594 aa  306  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.01 
 
 		 1003 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.93 
 
 		 971 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  37.19 
 
 		 638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  36.7 
 
 		 712 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  35.71 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  39.19 
 
 		 642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  37.97 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  33.97 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>