More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2527 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  45.77 
 
 		 1001 aa  837    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  55.52 
 
 		 980 aa  1097    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  46.88 
 
 		 1024 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.9 
 
 		 1013 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  47.27 
 
 		 1003 aa  843    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  46.15 
 
 		 1008 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  42.52 
 
 		 968 aa  787    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  57.31 
 
 		 930 aa  1070    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.14 
 
 		 1006 aa  767    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  80.21 
 
 		 971 aa  1580    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  50.49 
 
 		 986 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  100 
 
 		 976 aa  1976    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  38.52 
 
 		 982 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.15 
 
 		 1000 aa  857    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  44.13 
 
 		 999 aa  805    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  65.82 
 
 		 975 aa  1243    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.57 
 
 		 1016 aa  779    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.18 
 
 		 1012 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  46.15 
 
 		 1008 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  46.79 
 
 		 865 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  42.74 
 
 		 892 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.18 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  45.94 
 
 		 739 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  42.11 
 
 		 724 aa  532  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  42.11 
 
 		 724 aa  532  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  43.42 
 
 		 705 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  43.84 
 
 		 712 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  45.88 
 
 		 739 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 720 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  45.88 
 
 		 741 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  41.57 
 
 		 725 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  45.47 
 
 		 720 aa  519  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  39.91 
 
 		 731 aa  519  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  44.13 
 
 		 720 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  43.01 
 
 		 721 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  41.98 
 
 		 700 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  44.44 
 
 		 728 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  44.08 
 
 		 743 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  44.58 
 
 		 731 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  44.43 
 
 		 728 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  44.65 
 
 		 750 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  43.64 
 
 		 706 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  43.96 
 
 		 726 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  41.05 
 
 		 699 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  45.61 
 
 		 753 aa  489  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.72 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  38.58 
 
 		 906 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.43 
 
 		 1019 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.12 
 
 		 717 aa  479  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  39.14 
 
 		 719 aa  479  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.4 
 
 		 908 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  42.76 
 
 		 726 aa  469  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  39.67 
 
 		 1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  39.52 
 
 		 1038 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  38.37 
 
 		 712 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  38.37 
 
 		 712 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  38.22 
 
 		 712 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.61 
 
 		 1013 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  37.2 
 
 		 908 aa  448  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  38.43 
 
 		 1042 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  39.22 
 
 		 1011 aa  436  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  41.05 
 
 		 523 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.22 
 
 		 1040 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  40.52 
 
 		 714 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  36.09 
 
 		 714 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.01 
 
 		 1018 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  35.76 
 
 		 714 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.24 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  41.23 
 
 		 715 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.23 
 
 		 715 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.83 
 
 		 1018 aa  386  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  37.63 
 
 		 740 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  37.88 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  36.45 
 
 		 724 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.61 
 
 		 724 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  35.73 
 
 		 740 aa  365  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  33.28 
 
 		 727 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  35.58 
 
 		 721 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  32.14 
 
 		 734 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  31.82 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  33.22 
 
 		 716 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.16 
 
 		 717 aa  341  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.46 
 
 		 738 aa  341  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  33.45 
 
 		 744 aa  341  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  32.38 
 
 		 744 aa  340  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.4 
 
 		 597 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.9 
 
 		 759 aa  337  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  35.3 
 
 		 743 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  33.33 
 
 		 738 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  32.64 
 
 		 739 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.88 
 
 		 580 aa  327  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.72 
 
 		 736 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.45 
 
 		 727 aa  323  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.15 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  31.44 
 
 		 760 aa  321  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.12 
 
 		 725 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  33.23 
 
 		 742 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  33.57 
 
 		 721 aa  320  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.62 
 
 		 556 aa  319  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  33.39 
 
 		 741 aa  319  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>