More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2576 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  67.71 
 
 
731 aa  953    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  67.27 
 
 
725 aa  975    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  61.08 
 
 
712 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  62.87 
 
 
720 aa  865    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  51.01 
 
 
739 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  55.48 
 
 
706 aa  784    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  67.32 
 
 
720 aa  978    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  64.99 
 
 
728 aa  911    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  47.03 
 
 
700 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  63.01 
 
 
720 aa  867    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  64.13 
 
 
728 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  55.63 
 
 
705 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  65.36 
 
 
753 aa  871    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  48.06 
 
 
724 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  50.35 
 
 
739 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  100 
 
 
750 aa  1498    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.9 
 
 
717 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  57.05 
 
 
726 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  48.06 
 
 
724 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  51.69 
 
 
741 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  50.14 
 
 
721 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  56.98 
 
 
731 aa  802    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  50.14 
 
 
720 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  63.73 
 
 
743 aa  927    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  47.68 
 
 
726 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  44.26 
 
 
892 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  45.53 
 
 
712 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  45.53 
 
 
712 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.82 
 
 
865 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  43.43 
 
 
699 aa  588  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  45.39 
 
 
712 aa  588  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.18 
 
 
1024 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  48.17 
 
 
714 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  42.04 
 
 
719 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.74 
 
 
1008 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.35 
 
 
1000 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.74 
 
 
1008 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.07 
 
 
1003 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.45 
 
 
1001 aa  538  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.38 
 
 
999 aa  522  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  51.18 
 
 
523 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.33 
 
 
1013 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.56 
 
 
971 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  47.39 
 
 
715 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  40.17 
 
 
714 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.18 
 
 
1016 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.39 
 
 
715 aa  505  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.65 
 
 
976 aa  505  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  40.54 
 
 
714 aa  502  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  39.22 
 
 
930 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  40.08 
 
 
1038 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.73 
 
 
1012 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.06 
 
 
1019 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  39.94 
 
 
1038 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  37.97 
 
 
980 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  41.83 
 
 
975 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.67 
 
 
1006 aa  488  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  39.86 
 
 
740 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
906 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
906 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.11 
 
 
908 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  38.69 
 
 
908 aa  476  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.3 
 
 
1013 aa  475  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  39.44 
 
 
1011 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  37.69 
 
 
986 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  34.69 
 
 
968 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  34.41 
 
 
982 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  36.07 
 
 
1018 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  35.51 
 
 
1040 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.96 
 
 
1018 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.6 
 
 
1018 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  38.33 
 
 
730 aa  436  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  38.6 
 
 
740 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.25 
 
 
1042 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  35.24 
 
 
744 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  34.82 
 
 
744 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.06 
 
 
736 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  38.62 
 
 
724 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  39.32 
 
 
724 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  50.97 
 
 
368 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  34.24 
 
 
767 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.17 
 
 
759 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.76 
 
 
770 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.83 
 
 
717 aa  365  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  31.33 
 
 
727 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  36.15 
 
 
741 aa  354  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  33.33 
 
 
742 aa  353  5e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  31.79 
 
 
721 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.43 
 
 
718 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32 
 
 
718 aa  345  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  30.71 
 
 
726 aa  345  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.85 
 
 
738 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  31.15 
 
 
734 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.3 
 
 
738 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  29.78 
 
 
716 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  32.9 
 
 
737 aa  340  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  31.44 
 
 
721 aa  338  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.34 
 
 
734 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30.85 
 
 
734 aa  337  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.31 
 
 
739 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>