More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0558 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  47.2 
 
 		 737 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  100 
 
 		 725 aa  1497    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 726 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 728 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  55.49 
 
 		 730 aa  840    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  53.49 
 
 		 735 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0781  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 827 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  55.38 
 
 		 802 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  48.38 
 
 		 771 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  53.49 
 
 		 741 aa  815    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  54.26 
 
 		 773 aa  860    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  43.23 
 
 		 735 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.31 
 
 		 1040 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.92 
 
 		 906 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.16 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 1038 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.91 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 1038 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.3 
 
 		 1018 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.44 
 
 		 1018 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.35 
 
 		 1013 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.77 
 
 		 1011 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.14 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  32.6 
 
 		 739 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.67 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.1 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.5 
 
 		 1000 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.44 
 
 		 1042 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.96 
 
 		 738 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.59 
 
 		 999 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  32.83 
 
 		 738 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  30.33 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.92 
 
 		 1024 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.47 
 
 		 734 aa  353  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.48 
 
 		 722 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.89 
 
 		 1008 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.89 
 
 		 1008 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.86 
 
 		 986 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  31.12 
 
 		 716 aa  350  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30.19 
 
 		 734 aa  350  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.48 
 
 		 739 aa  350  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.98 
 
 		 1003 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  32.03 
 
 		 721 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.69 
 
 		 721 aa  344  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  30.56 
 
 		 760 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.73 
 
 		 741 aa  343  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.2 
 
 		 714 aa  341  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.4 
 
 		 1001 aa  340  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.69 
 
 		 724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.69 
 
 		 724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.86 
 
 		 717 aa  336  9e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  31.24 
 
 		 716 aa  336  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.71 
 
 		 725 aa  333  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.5 
 
 		 743 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.21 
 
 		 720 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.39 
 
 		 719 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  29.93 
 
 		 715 aa  332  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.75 
 
 		 930 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  28.51 
 
 		 719 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  29.51 
 
 		 695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  28.65 
 
 		 736 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.01 
 
 		 712 aa  327  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.14 
 
 		 719 aa  327  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.27 
 
 		 720 aa  327  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.4 
 
 		 750 aa  327  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.19 
 
 		 731 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  28.02 
 
 		 747 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  35.34 
 
 		 712 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.55 
 
 		 721 aa  324  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  34.43 
 
 		 720 aa  324  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  34.06 
 
 		 720 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  27.72 
 
 		 716 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  29.36 
 
 		 699 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.21 
 
 		 759 aa  322  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  26.86 
 
 		 715 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.12 
 
 		 976 aa  321  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.13 
 
 		 726 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.08 
 
 		 721 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.65 
 
 		 733 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.9 
 
 		 1013 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  29.13 
 
 		 728 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  29.51 
 
 		 726 aa  314  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  28.63 
 
 		 772 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 753 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  27.98 
 
 		 732 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.81 
 
 		 731 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 753 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.02 
 
 		 971 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.33 
 
 		 770 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  31.38 
 
 		 706 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  28.67 
 
 		 739 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.34 
 
 		 1012 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.82 
 
 		 726 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.25 
 
 		 725 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  29.45 
 
 		 918 aa  310  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 		 753 aa  310  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.35 
 
 		 753 aa  310  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.89 
 
 		 980 aa  309  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 		 753 aa  310  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>