More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1164 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  58.71 
 
 		 721 aa  911    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  100 
 
 		 716 aa  1449    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  54.98 
 
 		 738 aa  856    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.6 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  41.4 
 
 		 727 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  39.75 
 
 		 734 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  39.75 
 
 		 734 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  38.9 
 
 		 727 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  38.46 
 
 		 739 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.85 
 
 		 717 aa  468  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  36.97 
 
 		 760 aa  465  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  35.61 
 
 		 908 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  36.22 
 
 		 721 aa  442  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 906 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  34.87 
 
 		 747 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  34.83 
 
 		 906 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.86 
 
 		 759 aa  426  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.29 
 
 		 1019 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.21 
 
 		 908 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 1038 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 1038 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.39 
 
 		 1011 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.4 
 
 		 1040 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.38 
 
 		 1013 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.22 
 
 		 1018 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.4 
 
 		 1018 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.31 
 
 		 1018 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  33.61 
 
 		 716 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.61 
 
 		 1042 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.63 
 
 		 722 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  31.93 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 1000 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30 
 
 		 720 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.2 
 
 		 1001 aa  355  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.12 
 
 		 725 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.07 
 
 		 1024 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  31.73 
 
 		 722 aa  346  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.66 
 
 		 1003 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  31.62 
 
 		 968 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.21 
 
 		 728 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  31.76 
 
 		 728 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  29.83 
 
 		 736 aa  344  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.38 
 
 		 930 aa  344  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.22 
 
 		 976 aa  343  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  31.56 
 
 		 722 aa  343  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 724 aa  343  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 724 aa  343  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.78 
 
 		 731 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.45 
 
 		 971 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.81 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.81 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.78 
 
 		 750 aa  340  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.34 
 
 		 725 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.18 
 
 		 892 aa  340  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.57 
 
 		 1013 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.91 
 
 		 865 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.42 
 
 		 730 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  30 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  32.12 
 
 		 975 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.17 
 
 		 1012 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  32.97 
 
 		 735 aa  333  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  31.47 
 
 		 706 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.4 
 
 		 731 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.68 
 
 		 980 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.27 
 
 		 743 aa  330  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.48 
 
 		 1016 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  42.01 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  30.85 
 
 		 738 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.87 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.65 
 
 		 986 aa  324  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.62 
 
 		 999 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  30.73 
 
 		 715 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.42 
 
 		 714 aa  320  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  30.14 
 
 		 741 aa  319  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  28.4 
 
 		 737 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  33.38 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 743 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  29.87 
 
 		 719 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  27.9 
 
 		 726 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  30 
 
 		 771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 598 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  26.9 
 
 		 726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  31.23 
 
 		 982 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 726 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 		 741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.12 
 
 		 700 aa  306  6e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.37 
 
 		 739 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  27.87 
 
 		 712 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.54 
 
 		 556 aa  302  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  44.84 
 
 		 521 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.26 
 
 		 733 aa  301  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  27.73 
 
 		 712 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  29.29 
 
 		 688 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 728 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  29.33 
 
 		 753 aa  300  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  28.23 
 
 		 740 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  29.93 
 
 		 699 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 1006 aa  297  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  28.09 
 
 		 720 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  27.73 
 
 		 712 aa  296  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>