More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1143 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 753 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  44.32 
 
 		 721 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  46.69 
 
 		 725 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  51.21 
 
 		 739 aa  730    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  53.56 
 
 		 712 aa  786    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.78 
 
 		 753 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  52.65 
 
 		 704 aa  713    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  50.57 
 
 		 719 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  50.93 
 
 		 772 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  48.88 
 
 		 767 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.21 
 
 		 770 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 753 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 707 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  100 
 
 		 733 aa  1496    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  51.24 
 
 		 707 aa  697    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  49.78 
 
 		 688 aa  691    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 		 753 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  50.78 
 
 		 719 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  51.13 
 
 		 723 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 		 753 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  51.13 
 
 		 723 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 		 753 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  42.54 
 
 		 726 aa  628  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  44.25 
 
 		 704 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  44.7 
 
 		 719 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  44.25 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.25 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  45.97 
 
 		 726 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  44.44 
 
 		 723 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  39.63 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  44.59 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  43.75 
 
 		 683 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  40.5 
 
 		 695 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  44.19 
 
 		 696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  44.44 
 
 		 723 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  43.7 
 
 		 714 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  43.7 
 
 		 719 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 		 711 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  38.42 
 
 		 724 aa  547  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 918 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 		 1038 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 		 1038 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  31.53 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.57 
 
 		 726 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.97 
 
 		 1040 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.86 
 
 		 1019 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  31.98 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.57 
 
 		 1018 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  31.84 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  31.84 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.8 
 
 		 721 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  31.84 
 
 		 706 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.35 
 
 		 1018 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 707 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 707 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 707 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 707 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.91 
 
 		 720 aa  356  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  31.09 
 
 		 707 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 		 707 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.16 
 
 		 906 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 		 707 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.45 
 
 		 727 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.78 
 
 		 1018 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.02 
 
 		 906 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.19 
 
 		 1013 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.3 
 
 		 908 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  32.05 
 
 		 1011 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.43 
 
 		 739 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  32.31 
 
 		 908 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.94 
 
 		 1042 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.73 
 
 		 717 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  31.21 
 
 		 727 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  31.55 
 
 		 737 aa  326  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  33 
 
 		 725 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.7 
 
 		 721 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.47 
 
 		 738 aa  323  8e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  31.69 
 
 		 726 aa  323  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.88 
 
 		 727 aa  320  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  30.09 
 
 		 724 aa  320  7e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.49 
 
 		 734 aa  320  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.49 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.15 
 
 		 759 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.65 
 
 		 725 aa  316  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.21 
 
 		 734 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.44 
 
 		 720 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.44 
 
 		 738 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  29.66 
 
 		 724 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.49 
 
 		 739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  29.76 
 
 		 715 aa  313  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.26 
 
 		 980 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.86 
 
 		 700 aa  310  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.67 
 
 		 731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.03 
 
 		 725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.47 
 
 		 731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.96 
 
 		 721 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.5 
 
 		 734 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.67 
 
 		 721 aa  307  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.09 
 
 		 930 aa  306  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>