More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1653 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  45.98 
 
 
716 aa  639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  59.66 
 
 
715 aa  889    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  100 
 
 
722 aa  1479    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  40.69 
 
 
734 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  39.53 
 
 
739 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  40.56 
 
 
734 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.2 
 
 
738 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  38.02 
 
 
727 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  38 
 
 
727 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.11 
 
 
717 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.64 
 
 
721 aa  448  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  35.92 
 
 
747 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  35.24 
 
 
760 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 
1038 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 
1038 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.73 
 
 
759 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.01 
 
 
1019 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  33.9 
 
 
721 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  31.62 
 
 
738 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.24 
 
 
908 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.87 
 
 
908 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.22 
 
 
1040 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.6 
 
 
906 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.97 
 
 
906 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  30.63 
 
 
716 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  30.29 
 
 
1042 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.45 
 
 
1018 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.3 
 
 
1013 aa  357  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.49 
 
 
1018 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.26 
 
 
1018 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.48 
 
 
725 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  30.82 
 
 
1011 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.22 
 
 
726 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  30.28 
 
 
716 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.09 
 
 
722 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  28.49 
 
 
736 aa  338  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  30.35 
 
 
715 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  30.18 
 
 
730 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  30.26 
 
 
741 aa  333  9e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  29.95 
 
 
722 aa  331  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.84 
 
 
720 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  39.36 
 
 
455 aa  320  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.47 
 
 
750 aa  320  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  28.95 
 
 
720 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.89 
 
 
725 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.28 
 
 
737 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.82 
 
 
865 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.52 
 
 
731 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.21 
 
 
731 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.25 
 
 
728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.29 
 
 
739 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 
892 aa  309  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 
720 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.03 
 
 
712 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.97 
 
 
741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  31.57 
 
 
720 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.19 
 
 
743 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  29.02 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
1000 aa  304  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  27.52 
 
 
733 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.53 
 
 
728 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.93 
 
 
971 aa  303  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  30.66 
 
 
735 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  29.62 
 
 
753 aa  301  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.61 
 
 
743 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.33 
 
 
714 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  26.65 
 
 
726 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.18 
 
 
717 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.86 
 
 
726 aa  297  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.9 
 
 
976 aa  297  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.19 
 
 
1024 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.82 
 
 
1008 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.82 
 
 
1008 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.31 
 
 
721 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  29.94 
 
 
706 aa  296  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.1 
 
 
700 aa  295  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  27.98 
 
 
705 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.01 
 
 
724 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.01 
 
 
724 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.89 
 
 
975 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.85 
 
 
930 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.11 
 
 
721 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  26.93 
 
 
725 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  41.51 
 
 
521 aa  291  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  28.53 
 
 
726 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  29.1 
 
 
1675 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.18 
 
 
1001 aa  288  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  27.3 
 
 
738 aa  287  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.2 
 
 
1003 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.93 
 
 
1006 aa  284  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30 
 
 
1013 aa  284  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  28.53 
 
 
740 aa  282  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  27.81 
 
 
773 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  26.74 
 
 
734 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  30.41 
 
 
714 aa  280  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.36 
 
 
748 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  27.12 
 
 
802 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.98 
 
 
1016 aa  277  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  27.8 
 
 
918 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  28.25 
 
 
714 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>