More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0084 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  47.08 
 
 
716 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  100 
 
 
715 aa  1458    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  59.66 
 
 
722 aa  889    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  38.3 
 
 
739 aa  522  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  38.33 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  38.19 
 
 
734 aa  515  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  38.61 
 
 
727 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.83 
 
 
738 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.2 
 
 
717 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  36.11 
 
 
727 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  36.16 
 
 
747 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  33.76 
 
 
760 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  32.15 
 
 
721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
1038 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
1038 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.78 
 
 
1019 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.73 
 
 
759 aa  395  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.75 
 
 
906 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  32.78 
 
 
908 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.75 
 
 
906 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  32.21 
 
 
721 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.7 
 
 
908 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.75 
 
 
1040 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.67 
 
 
1011 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.22 
 
 
1013 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  31.93 
 
 
716 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.51 
 
 
1018 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.89 
 
 
738 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.25 
 
 
1018 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.11 
 
 
1018 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  30.85 
 
 
730 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.75 
 
 
1042 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  29.93 
 
 
725 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  28.81 
 
 
736 aa  330  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.19 
 
 
726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.92 
 
 
720 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.29 
 
 
731 aa  317  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  30.75 
 
 
704 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.75 
 
 
704 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  40.87 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  30.75 
 
 
704 aa  316  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.39 
 
 
722 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  27.41 
 
 
722 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.29 
 
 
728 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.62 
 
 
743 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.33 
 
 
976 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.93 
 
 
737 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.22 
 
 
720 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.73 
 
 
716 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
1000 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.59 
 
 
731 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.91 
 
 
741 aa  310  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.17 
 
 
725 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.36 
 
 
743 aa  308  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.71 
 
 
715 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.35 
 
 
728 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.55 
 
 
865 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  29.2 
 
 
733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  29.86 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.38 
 
 
772 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.73 
 
 
1013 aa  300  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.36 
 
 
770 aa  300  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.34 
 
 
714 aa  299  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
735 aa  297  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.1 
 
 
753 aa  296  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
753 aa  296  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
753 aa  296  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
753 aa  296  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  30.06 
 
 
706 aa  296  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.69 
 
 
726 aa  296  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.15 
 
 
930 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  31.37 
 
 
968 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.24 
 
 
712 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.91 
 
 
971 aa  293  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.4 
 
 
975 aa  293  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.61 
 
 
728 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.08 
 
 
741 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.86 
 
 
980 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.44 
 
 
739 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  30.17 
 
 
695 aa  290  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 
724 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 
724 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 
720 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.32 
 
 
1008 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.32 
 
 
1008 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  27.87 
 
 
750 aa  288  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 
892 aa  287  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  27.05 
 
 
735 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.68 
 
 
705 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.62 
 
 
1024 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  29.65 
 
 
720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  27.71 
 
 
802 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.32 
 
 
1016 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  29.78 
 
 
711 aa  283  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  27.34 
 
 
719 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  27.48 
 
 
773 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.92 
 
 
725 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  28.96 
 
 
734 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>