More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3696 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  49.86 
 
 		 731 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  49.72 
 
 		 725 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  49.45 
 
 		 728 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  67.33 
 
 		 717 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  49.44 
 
 		 720 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  60.34 
 
 		 739 aa  873    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  49.43 
 
 		 706 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  49.93 
 
 		 720 aa  657    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  69 
 
 		 721 aa  1012    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 720 aa  1446    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  49.93 
 
 		 726 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  49.79 
 
 		 705 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  63.77 
 
 		 726 aa  887    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  49.18 
 
 		 728 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  60.28 
 
 		 741 aa  868    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  51.47 
 
 		 753 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  50.36 
 
 		 731 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  49.09 
 
 		 743 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  50.07 
 
 		 720 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  50.21 
 
 		 750 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  49.29 
 
 		 712 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  45.71 
 
 		 739 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  47.4 
 
 		 724 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  44.32 
 
 		 700 aa  595  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  47.4 
 
 		 724 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.63 
 
 		 699 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  43.31 
 
 		 712 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  43.18 
 
 		 712 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  43.31 
 
 		 712 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  41.96 
 
 		 892 aa  534  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.48 
 
 		 865 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  40.03 
 
 		 719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  45.44 
 
 		 971 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.13 
 
 		 976 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.41 
 
 		 1003 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 1000 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.5 
 
 		 1024 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.19 
 
 		 1016 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  46.6 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.71 
 
 		 1008 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.71 
 
 		 1008 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  43.53 
 
 		 980 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  42.64 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.15 
 
 		 1001 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.53 
 
 		 1013 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.03 
 
 		 1012 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  38.9 
 
 		 714 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.15 
 
 		 715 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  47.98 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  45.17 
 
 		 999 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  43.3 
 
 		 975 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  38.62 
 
 		 714 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  38.62 
 
 		 740 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  42.78 
 
 		 986 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  46.09 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  40.38 
 
 		 968 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.41 
 
 		 1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  37.86 
 
 		 1038 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.5 
 
 		 908 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.08 
 
 		 906 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  37.71 
 
 		 1038 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  37.94 
 
 		 906 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.89 
 
 		 1006 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  37.57 
 
 		 908 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.6 
 
 		 1042 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.45 
 
 		 1013 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  41.67 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  39.75 
 
 		 724 aa  416  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  39.47 
 
 		 724 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  37.77 
 
 		 1011 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.78 
 
 		 736 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  37.08 
 
 		 982 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  37.27 
 
 		 730 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.46 
 
 		 1018 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.59 
 
 		 1040 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.61 
 
 		 1018 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.85 
 
 		 1018 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  33.29 
 
 		 744 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  37.12 
 
 		 741 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  33.01 
 
 		 744 aa  369  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  34.89 
 
 		 770 aa  361  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  35.34 
 
 		 767 aa  356  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  32.68 
 
 		 742 aa  340  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  31.41 
 
 		 704 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  34.2 
 
 		 731 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  35.01 
 
 		 737 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  34.06 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  33.33 
 
 		 722 aa  331  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  33.19 
 
 		 721 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.43 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  30.7 
 
 		 718 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  30.7 
 
 		 718 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.49 
 
 		 721 aa  324  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  31.28 
 
 		 734 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.99 
 
 		 731 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  33.51 
 
 		 718 aa  320  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  30.56 
 
 		 712 aa  319  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.9 
 
 		 725 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.19 
 
 		 738 aa  318  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  34.67 
 
 		 726 aa  316  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>