More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1584 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  100 
 
 
688 aa  1391    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  45.98 
 
 
721 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  48.01 
 
 
725 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  48.96 
 
 
723 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.22 
 
 
753 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  54.07 
 
 
739 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 
753 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  63.62 
 
 
707 aa  860    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  64.93 
 
 
707 aa  861    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  55.83 
 
 
712 aa  764    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  55.37 
 
 
772 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  67.06 
 
 
704 aa  887    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.22 
 
 
770 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 
753 aa  718    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  49.78 
 
 
733 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  52.54 
 
 
719 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  48.96 
 
 
723 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 
753 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  51.27 
 
 
767 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  52.69 
 
 
719 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 
753 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  50.15 
 
 
719 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 
753 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  47.93 
 
 
683 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  43.03 
 
 
726 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  45.66 
 
 
726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  46.62 
 
 
714 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  40.72 
 
 
699 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  46.12 
 
 
723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  41.91 
 
 
724 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  45.97 
 
 
723 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  41.14 
 
 
704 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  40.27 
 
 
695 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  45.45 
 
 
696 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  41.14 
 
 
704 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.14 
 
 
704 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  46.42 
 
 
723 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  42.86 
 
 
719 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  42.56 
 
 
711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
918 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.97 
 
 
1019 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  32.33 
 
 
706 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  32.48 
 
 
706 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  32.48 
 
 
706 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  32.48 
 
 
706 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 
1038 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.43 
 
 
1038 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 
707 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  33.67 
 
 
721 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
906 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
906 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  30.88 
 
 
707 aa  346  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.04 
 
 
1040 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.63 
 
 
1013 aa  342  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.55 
 
 
908 aa  334  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.32 
 
 
726 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.85 
 
 
700 aa  332  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.01 
 
 
1018 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.24 
 
 
1018 aa  329  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  32.54 
 
 
1011 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.84 
 
 
1042 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.3 
 
 
908 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.8 
 
 
1018 aa  327  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  32.34 
 
 
930 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.98 
 
 
720 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  31.23 
 
 
720 aa  312  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.14 
 
 
725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  33.6 
 
 
705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.52 
 
 
728 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.06 
 
 
971 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.27 
 
 
976 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.52 
 
 
980 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.99 
 
 
725 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  29.72 
 
 
716 aa  303  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  31.02 
 
 
728 aa  303  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  29.81 
 
 
720 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  31.26 
 
 
750 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.65 
 
 
731 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.93 
 
 
1000 aa  301  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  29.93 
 
 
727 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.38 
 
 
699 aa  301  4e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.47 
 
 
743 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.97 
 
 
721 aa  300  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.91 
 
 
730 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.12 
 
 
721 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 
892 aa  297  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.79 
 
 
741 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.71 
 
 
975 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.67 
 
 
721 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  31.59 
 
 
726 aa  293  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.01 
 
 
968 aa  293  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  33.65 
 
 
753 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.92 
 
 
727 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>