More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2317 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 711 aa  1446    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  47.04 
 
 		 712 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  44.7 
 
 		 772 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.76 
 
 		 770 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 753 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 753 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.57 
 
 		 753 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 753 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 753 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 753 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  44.55 
 
 		 739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  43.88 
 
 		 719 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  44.17 
 
 		 719 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  40.57 
 
 		 704 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.57 
 
 		 704 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  40.57 
 
 		 704 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  41.55 
 
 		 733 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  41.05 
 
 		 725 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  41.76 
 
 		 723 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  41.76 
 
 		 723 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  43.11 
 
 		 704 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  41.78 
 
 		 707 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  38.63 
 
 		 695 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  37.57 
 
 		 726 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  41.74 
 
 		 696 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  42.56 
 
 		 688 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  40.62 
 
 		 767 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  41.32 
 
 		 726 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  37.28 
 
 		 699 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  40.92 
 
 		 714 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  40.2 
 
 		 723 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  36.53 
 
 		 721 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  40.06 
 
 		 723 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  38.04 
 
 		 719 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  40.17 
 
 		 723 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  36.86 
 
 		 724 aa  485  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  38.78 
 
 		 719 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  37.72 
 
 		 683 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 918 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  33.19 
 
 		 706 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  33.19 
 
 		 706 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.86 
 
 		 707 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  32.86 
 
 		 707 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.86 
 
 		 707 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.86 
 
 		 707 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  33.05 
 
 		 706 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 		 707 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 		 707 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  33.19 
 
 		 706 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.44 
 
 		 707 aa  357  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.46 
 
 		 721 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.67 
 
 		 726 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.14 
 
 		 1018 aa  343  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.09 
 
 		 1040 aa  343  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.47 
 
 		 1018 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  29.36 
 
 		 707 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.62 
 
 		 1018 aa  326  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32 
 
 		 720 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.11 
 
 		 1013 aa  323  6e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 1038 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 1038 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.59 
 
 		 1019 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  30.03 
 
 		 1042 aa  310  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 743 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  32.34 
 
 		 908 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  31.21 
 
 		 728 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  30.65 
 
 		 730 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.29 
 
 		 906 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.35 
 
 		 728 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.76 
 
 		 748 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 906 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  28.19 
 
 		 737 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.47 
 
 		 731 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.13 
 
 		 1011 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  30.37 
 
 		 724 aa  298  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  29.92 
 
 		 715 aa  297  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  30.59 
 
 		 724 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.14 
 
 		 908 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.65 
 
 		 724 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.65 
 
 		 724 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.59 
 
 		 720 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  26.1 
 
 		 725 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.68 
 
 		 734 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.79 
 
 		 741 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.82 
 
 		 715 aa  290  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.63 
 
 		 725 aa  290  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.65 
 
 		 721 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.41 
 
 		 727 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.4 
 
 		 734 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.33 
 
 		 734 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.94 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.33 
 
 		 732 aa  284  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.77 
 
 		 721 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  29.97 
 
 		 753 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.39 
 
 		 731 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.44 
 
 		 738 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  29.94 
 
 		 727 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.64 
 
 		 700 aa  277  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.29 
 
 		 727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>