More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0558 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  99.72 
 
 		 707 aa  1434    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  44.98 
 
 		 721 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  47.36 
 
 		 725 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  53.29 
 
 		 739 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.24 
 
 		 753 aa  744    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  51 
 
 		 723 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  64.93 
 
 		 688 aa  877    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 753 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  54.53 
 
 		 772 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 707 aa  1440    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  49.19 
 
 		 719 aa  683    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.99 
 
 		 770 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.53 
 
 		 753 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  51.24 
 
 		 733 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  53.23 
 
 		 719 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.53 
 
 		 753 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  53.52 
 
 		 719 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  51 
 
 		 723 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  51.1 
 
 		 767 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  78.14 
 
 		 704 aa  1080    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 753 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  55.49 
 
 		 712 aa  777    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 753 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  44.46 
 
 		 726 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  45.88 
 
 		 726 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  46.93 
 
 		 683 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  43.64 
 
 		 704 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  43.64 
 
 		 704 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  45.8 
 
 		 714 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.64 
 
 		 704 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  41.07 
 
 		 699 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  44.96 
 
 		 723 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  44.96 
 
 		 723 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  41.33 
 
 		 695 aa  572  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  43.21 
 
 		 719 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  41.68 
 
 		 724 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  44.82 
 
 		 723 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  44.38 
 
 		 696 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  41.92 
 
 		 711 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 918 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.39 
 
 		 1019 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  34.45 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  36.17 
 
 		 721 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 1038 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 1038 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  34.99 
 
 		 706 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 906 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  34.74 
 
 		 706 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  34.74 
 
 		 706 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.92 
 
 		 906 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  34.74 
 
 		 706 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  33.87 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 707 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.58 
 
 		 908 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.14 
 
 		 1011 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.97 
 
 		 1013 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.67 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.22 
 
 		 1040 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.17 
 
 		 1018 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.32 
 
 		 720 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.17 
 
 		 1018 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.02 
 
 		 1018 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.4 
 
 		 1042 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.98 
 
 		 726 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.75 
 
 		 700 aa  343  9e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 743 aa  340  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.41 
 
 		 727 aa  334  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  31.54 
 
 		 725 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.93 
 
 		 930 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  31.34 
 
 		 727 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  31.14 
 
 		 727 aa  327  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.6 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 1000 aa  325  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.77 
 
 		 721 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.75 
 
 		 725 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.31 
 
 		 734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.92 
 
 		 738 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.77 
 
 		 721 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.1 
 
 		 720 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.9 
 
 		 721 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.09 
 
 		 743 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.91 
 
 		 705 aa  317  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.4 
 
 		 731 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.78 
 
 		 750 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.45 
 
 		 717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.16 
 
 		 728 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.85 
 
 		 730 aa  313  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  30.14 
 
 		 737 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.91 
 
 		 728 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.24 
 
 		 741 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.08 
 
 		 980 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  35.19 
 
 		 753 aa  310  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  29.03 
 
 		 721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.91 
 
 		 732 aa  309  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  29.59 
 
 		 737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>