More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6343 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  100 
 
 		 719 aa  1462    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  46.35 
 
 		 725 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  45.72 
 
 		 721 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  45.3 
 
 		 712 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  45.48 
 
 		 719 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  43.7 
 
 		 733 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  41.47 
 
 		 726 aa  591  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  45.04 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  44.48 
 
 		 739 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 753 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  44.25 
 
 		 772 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  42.96 
 
 		 726 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.9 
 
 		 753 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 753 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 753 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 753 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.96 
 
 		 770 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 		 707 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  43.21 
 
 		 707 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  42.86 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  41.65 
 
 		 723 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  40.51 
 
 		 724 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  41.65 
 
 		 723 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  43.74 
 
 		 704 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  38.58 
 
 		 699 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  41.32 
 
 		 719 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  41.47 
 
 		 704 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  39.63 
 
 		 695 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  41.62 
 
 		 704 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.47 
 
 		 704 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  42.86 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  40.88 
 
 		 767 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  40.29 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  40.66 
 
 		 683 aa  495  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  38.97 
 
 		 723 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  39.26 
 
 		 723 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  39.54 
 
 		 723 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 711 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 918 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  32.28 
 
 		 707 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  32.66 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  32.61 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  32.61 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  32.61 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  31.62 
 
 		 707 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.62 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.77 
 
 		 726 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.99 
 
 		 721 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.88 
 
 		 720 aa  351  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 		 1038 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.96 
 
 		 1038 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.66 
 
 		 1019 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  30.87 
 
 		 908 aa  323  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 906 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 906 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 743 aa  317  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.99 
 
 		 1042 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.09 
 
 		 737 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.42 
 
 		 908 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.49 
 
 		 720 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.43 
 
 		 727 aa  303  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  30.1 
 
 		 706 aa  302  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.72 
 
 		 1013 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  30.07 
 
 		 705 aa  300  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.63 
 
 		 738 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.74 
 
 		 728 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  29.38 
 
 		 1011 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  28.72 
 
 		 1040 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.04 
 
 		 728 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.46 
 
 		 727 aa  292  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.31 
 
 		 730 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.74 
 
 		 1018 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  27.05 
 
 		 725 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.79 
 
 		 727 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.12 
 
 		 727 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.83 
 
 		 724 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.96 
 
 		 750 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.83 
 
 		 724 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.91 
 
 		 734 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.57 
 
 		 725 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.27 
 
 		 734 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.68 
 
 		 732 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.13 
 
 		 734 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.71 
 
 		 738 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.02 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 1000 aa  279  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.18 
 
 		 1018 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.44 
 
 		 715 aa  279  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.84 
 
 		 748 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.3 
 
 		 721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.55 
 
 		 1018 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  26.78 
 
 		 721 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.06 
 
 		 980 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>