More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4438 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  100 
 
 		 723 aa  1432    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  46.91 
 
 		 704 aa  657    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  46.76 
 
 		 704 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  52.28 
 
 		 696 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  96.95 
 
 		 723 aa  1282    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  48.29 
 
 		 739 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  75.67 
 
 		 714 aa  1016    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.76 
 
 		 704 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.64 
 
 		 770 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  47.82 
 
 		 712 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  99.59 
 
 		 723 aa  1425    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  47.44 
 
 		 719 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  47.58 
 
 		 719 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  53.31 
 
 		 726 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  44.21 
 
 		 725 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  48.07 
 
 		 772 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 753 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 753 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.79 
 
 		 753 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 753 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 753 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 753 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  44.59 
 
 		 733 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  47.01 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  41.25 
 
 		 721 aa  602  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  47.21 
 
 		 767 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  44.33 
 
 		 723 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  44.33 
 
 		 723 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  46.42 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  39.94 
 
 		 726 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 		 707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  44.82 
 
 		 707 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  41.93 
 
 		 724 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  38.16 
 
 		 695 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  40.93 
 
 		 719 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  37.05 
 
 		 699 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  41.7 
 
 		 683 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 		 711 aa  515  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  39.26 
 
 		 719 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 918 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  35.8 
 
 		 707 aa  379  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  33.19 
 
 		 706 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  32.08 
 
 		 726 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  32.96 
 
 		 706 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  32.96 
 
 		 706 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 707 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 707 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 707 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.05 
 
 		 707 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  32.96 
 
 		 706 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  32.9 
 
 		 707 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 707 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 707 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 743 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  34.01 
 
 		 721 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.02 
 
 		 1040 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  33.19 
 
 		 720 aa  343  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.75 
 
 		 1019 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.76 
 
 		 1018 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.09 
 
 		 1038 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.95 
 
 		 1038 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.79 
 
 		 1018 aa  323  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.04 
 
 		 1018 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.16 
 
 		 906 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  30.43 
 
 		 1011 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 906 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.53 
 
 		 725 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  30.69 
 
 		 727 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.86 
 
 		 1042 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.38 
 
 		 908 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.93 
 
 		 1013 aa  300  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.47 
 
 		 908 aa  293  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  29.71 
 
 		 705 aa  292  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.01 
 
 		 739 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.73 
 
 		 730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.14 
 
 		 721 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  31.31 
 
 		 734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 1000 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  31.84 
 
 		 727 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.68 
 
 		 725 aa  282  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.17 
 
 		 721 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.53 
 
 		 741 aa  280  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.21 
 
 		 760 aa  280  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.04 
 
 		 892 aa  280  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.07 
 
 		 720 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.37 
 
 		 728 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  29.31 
 
 		 706 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  27.1 
 
 		 737 aa  277  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.67 
 
 		 731 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.98 
 
 		 726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  31.3 
 
 		 725 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.82 
 
 		 700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.69 
 
 		 748 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32.24 
 
 		 720 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.14 
 
 		 865 aa  274  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.6 
 
 		 727 aa  274  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.22 
 
 		 721 aa  273  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.78 
 
 		 734 aa  272  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  26.25 
 
 		 727 aa  272  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.26 
 
 		 716 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>