More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0494 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
753 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  44.46 
 
 
726 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  44.9 
 
 
721 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  47.44 
 
 
725 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 
753 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.32 
 
 
753 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  63.62 
 
 
688 aa  876    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  50.86 
 
 
723 aa  743    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  54.55 
 
 
772 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  53.29 
 
 
739 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  99.72 
 
 
707 aa  1434    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.99 
 
 
770 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
753 aa  752    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  78 
 
 
704 aa  1077    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  51.24 
 
 
733 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  50.86 
 
 
723 aa  743    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  100 
 
 
707 aa  1439    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  53.23 
 
 
719 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  53.52 
 
 
719 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  50.88 
 
 
767 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 
753 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  49.26 
 
 
719 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  55.57 
 
 
712 aa  777    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 
753 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  46.03 
 
 
726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  46.93 
 
 
683 aa  602  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  43.87 
 
 
704 aa  592  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.87 
 
 
704 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  43.87 
 
 
704 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  45.59 
 
 
714 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  41.07 
 
 
699 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  44.82 
 
 
723 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  41.22 
 
 
695 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  43.21 
 
 
719 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  44.82 
 
 
723 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  41.53 
 
 
724 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  44.67 
 
 
723 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  44.53 
 
 
696 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
711 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
918 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.24 
 
 
1019 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  34.45 
 
 
707 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  36.31 
 
 
721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 
1038 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  34.45 
 
 
706 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  34.45 
 
 
706 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  34.69 
 
 
706 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  34.45 
 
 
706 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.36 
 
 
1038 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 
906 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 
906 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
707 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.14 
 
 
1011 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.43 
 
 
908 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.67 
 
 
908 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.82 
 
 
1013 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.13 
 
 
1040 aa  359  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.46 
 
 
720 aa  359  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.02 
 
 
1018 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.02 
 
 
1018 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.88 
 
 
1018 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.25 
 
 
1042 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.98 
 
 
726 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.6 
 
 
700 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
743 aa  336  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.41 
 
 
727 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  31.54 
 
 
725 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  31.2 
 
 
727 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  31.14 
 
 
727 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.78 
 
 
930 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.47 
 
 
734 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.08 
 
 
1000 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.86 
 
 
738 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.18 
 
 
734 aa  320  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.63 
 
 
721 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.6 
 
 
725 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.63 
 
 
721 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.45 
 
 
717 aa  316  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.96 
 
 
720 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
721 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.98 
 
 
730 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  30.14 
 
 
737 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.94 
 
 
743 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.36 
 
 
731 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.38 
 
 
741 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.75 
 
 
705 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.66 
 
 
750 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.91 
 
 
732 aa  311  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  29.03 
 
 
721 aa  310  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.01 
 
 
728 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  35.19 
 
 
753 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 
728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  29.59 
 
 
737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.92 
 
 
980 aa  306  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>