More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1296 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 728 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  100 
 
 		 730 aa  1483    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  55.49 
 
 		 725 aa  840    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  75.21 
 
 		 741 aa  1167    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  48.16 
 
 		 737 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  50.19 
 
 		 771 aa  765    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  47.36 
 
 		 773 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 726 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0781  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 827 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  50.44 
 
 		 802 aa  769    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 735 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  42.76 
 
 		 735 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.48 
 
 		 1040 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.97 
 
 		 1018 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.56 
 
 		 1018 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.43 
 
 		 1018 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.15 
 
 		 908 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 		 906 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 		 906 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.14 
 
 		 1038 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.92 
 
 		 1011 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.01 
 
 		 1038 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  32.88 
 
 		 908 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  33.33 
 
 		 727 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.83 
 
 		 738 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.83 
 
 		 1019 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.28 
 
 		 1013 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  33.92 
 
 		 727 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  33.7 
 
 		 739 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.85 
 
 		 1042 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  33.2 
 
 		 738 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  32.52 
 
 		 734 aa  356  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  32.38 
 
 		 734 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  33.88 
 
 		 760 aa  351  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.22 
 
 		 1000 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.24 
 
 		 717 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  30.85 
 
 		 715 aa  341  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  32.11 
 
 		 716 aa  341  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  33.42 
 
 		 716 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.18 
 
 		 722 aa  335  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.73 
 
 		 1024 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.83 
 
 		 999 aa  332  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  31.41 
 
 		 721 aa  330  6e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  31.61 
 
 		 721 aa  330  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.42 
 
 		 1003 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.1 
 
 		 714 aa  323  6e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.31 
 
 		 726 aa  320  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.41 
 
 		 759 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.18 
 
 		 731 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  31.15 
 
 		 986 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.72 
 
 		 712 aa  317  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 753 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.46 
 
 		 772 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.34 
 
 		 715 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 753 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  28.28 
 
 		 736 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.97 
 
 		 725 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.03 
 
 		 720 aa  313  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  29.11 
 
 		 739 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.22 
 
 		 739 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.81 
 
 		 1008 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.53 
 
 		 1001 aa  312  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.81 
 
 		 1008 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  33.68 
 
 		 720 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 720 aa  312  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 		 741 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.46 
 
 		 770 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.74 
 
 		 731 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.18 
 
 		 753 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 753 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 753 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 753 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.92 
 
 		 725 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.54 
 
 		 743 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.04 
 
 		 722 aa  310  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.67 
 
 		 716 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.22 
 
 		 865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.08 
 
 		 976 aa  308  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.15 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  30.18 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.15 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 892 aa  307  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.65 
 
 		 721 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  29.43 
 
 		 704 aa  306  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.4 
 
 		 980 aa  306  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.05 
 
 		 720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.82 
 
 		 722 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  32.03 
 
 		 712 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.07 
 
 		 728 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.44 
 
 		 971 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  30.07 
 
 		 699 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.49 
 
 		 728 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.16 
 
 		 1013 aa  301  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  28.98 
 
 		 707 aa  300  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.85 
 
 		 707 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  28.76 
 
 		 719 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.83 
 
 		 721 aa  297  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.91 
 
 		 930 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.8 
 
 		 721 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  28.88 
 
 		 767 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>