More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1690 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 735 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  47.36 
 
 		 730 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  100 
 
 		 773 aa  1587    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  53.76 
 
 		 728 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  48.38 
 
 		 741 aa  755    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  54.26 
 
 		 725 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  65.88 
 
 		 802 aa  1082    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0781  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 827 aa  889    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 771 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 726 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  43.21 
 
 		 737 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  40.57 
 
 		 735 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.5 
 
 		 1040 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.32 
 
 		 1019 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.65 
 
 		 1038 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.04 
 
 		 1018 aa  362  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  30.08 
 
 		 1011 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.83 
 
 		 1018 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.19 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.96 
 
 		 1018 aa  349  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  28.21 
 
 		 908 aa  348  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.02 
 
 		 1042 aa  346  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.92 
 
 		 1013 aa  346  8e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  29.28 
 
 		 906 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 906 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 1000 aa  337  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.78 
 
 		 738 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.89 
 
 		 908 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.83 
 
 		 1003 aa  327  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.55 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.94 
 
 		 999 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.92 
 
 		 1024 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.3 
 
 		 739 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.95 
 
 		 986 aa  313  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  28.57 
 
 		 716 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  28.88 
 
 		 930 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  27.42 
 
 		 715 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.17 
 
 		 759 aa  308  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  29.07 
 
 		 738 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.08 
 
 		 720 aa  308  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.76 
 
 		 721 aa  307  5.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.71 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.49 
 
 		 971 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.71 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.77 
 
 		 720 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  26.68 
 
 		 724 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  26.68 
 
 		 724 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.22 
 
 		 980 aa  304  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 750 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.12 
 
 		 734 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 712 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.68 
 
 		 717 aa  302  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.13 
 
 		 739 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.15 
 
 		 976 aa  302  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  31.6 
 
 		 720 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.57 
 
 		 865 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.81 
 
 		 722 aa  300  9e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.31 
 
 		 726 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  27.78 
 
 		 721 aa  299  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.26 
 
 		 741 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  27.48 
 
 		 715 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.86 
 
 		 734 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  27.55 
 
 		 975 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  27.89 
 
 		 726 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.1 
 
 		 1001 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  29.32 
 
 		 706 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 892 aa  294  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  28.87 
 
 		 721 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.36 
 
 		 1016 aa  293  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  27.2 
 
 		 731 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.97 
 
 		 731 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.53 
 
 		 700 aa  292  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  28.61 
 
 		 695 aa  292  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.41 
 
 		 728 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.26 
 
 		 721 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.75 
 
 		 760 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.15 
 
 		 1013 aa  289  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.36 
 
 		 725 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.11 
 
 		 705 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.18 
 
 		 720 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  26.98 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30 
 
 		 728 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.57 
 
 		 739 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  29.21 
 
 		 968 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.77 
 
 		 699 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.99 
 
 		 699 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  26.08 
 
 		 719 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.21 
 
 		 1012 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.55 
 
 		 736 aa  279  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  28.22 
 
 		 716 aa  279  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 743 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  31.16 
 
 		 720 aa  277  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  26.1 
 
 		 732 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  27.37 
 
 		 719 aa  274  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  30.07 
 
 		 726 aa  273  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  26.96 
 
 		 753 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  24.87 
 
 		 721 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  26.96 
 
 		 753 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>