More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0884 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  49.79 
 
 		 731 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  49.66 
 
 		 725 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  51.05 
 
 		 720 aa  683    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  49.65 
 
 		 720 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  68.7 
 
 		 721 aa  973    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  49.24 
 
 		 728 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  52.64 
 
 		 705 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  58.36 
 
 		 741 aa  832    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  50.28 
 
 		 728 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 720 aa  686    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  58.83 
 
 		 739 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  63.77 
 
 		 720 aa  907    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  51.28 
 
 		 712 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 726 aa  1457    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.91 
 
 		 717 aa  914    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  49.93 
 
 		 706 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  49.79 
 
 		 731 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  50.56 
 
 		 743 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  50.93 
 
 		 726 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  52.22 
 
 		 753 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  48.73 
 
 		 750 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  54.18 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  45.77 
 
 		 724 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  45.77 
 
 		 724 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  43.85 
 
 		 700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  42.6 
 
 		 712 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.14 
 
 		 699 aa  552  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  42.6 
 
 		 712 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  42.32 
 
 		 712 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  39.56 
 
 		 719 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.87 
 
 		 1003 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  40.45 
 
 		 865 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  40.06 
 
 		 892 aa  522  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.68 
 
 		 1008 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.68 
 
 		 1008 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  48.68 
 
 		 714 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.61 
 
 		 1001 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  39.89 
 
 		 980 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.02 
 
 		 1024 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.67 
 
 		 1000 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.23 
 
 		 1016 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  47.1 
 
 		 523 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.15 
 
 		 971 aa  485  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.35 
 
 		 1012 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.76 
 
 		 1013 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.76 
 
 		 976 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.61 
 
 		 999 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  41.79 
 
 		 930 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  40.53 
 
 		 714 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  42.18 
 
 		 986 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  40.09 
 
 		 714 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  42.26 
 
 		 975 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.59 
 
 		 1019 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  39.26 
 
 		 968 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.08 
 
 		 715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 1038 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  43.73 
 
 		 715 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  37.5 
 
 		 740 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.86 
 
 		 1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.09 
 
 		 908 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.1 
 
 		 906 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  37.96 
 
 		 906 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  39.81 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  39.84 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  37.2 
 
 		 1013 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.52 
 
 		 736 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  37.5 
 
 		 1011 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  35.2 
 
 		 1018 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  36.87 
 
 		 908 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  36.47 
 
 		 740 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.4 
 
 		 1018 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.27 
 
 		 1040 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  38.9 
 
 		 1042 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.45 
 
 		 1018 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  36.66 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  36.23 
 
 		 982 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  36.36 
 
 		 767 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  37.7 
 
 		 741 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  35.09 
 
 		 770 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  33.15 
 
 		 744 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  33.58 
 
 		 742 aa  361  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  33.52 
 
 		 744 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.94 
 
 		 717 aa  337  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  46.74 
 
 		 368 aa  337  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  31.54 
 
 		 737 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  34.24 
 
 		 718 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  32.63 
 
 		 733 aa  333  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  31.02 
 
 		 722 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  31.7 
 
 		 721 aa  330  6e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  30.07 
 
 		 718 aa  330  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  32.48 
 
 		 731 aa  330  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  30.07 
 
 		 718 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  31.84 
 
 		 776 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.74 
 
 		 726 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  31.69 
 
 		 734 aa  327  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.37 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  30.92 
 
 		 734 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  30.82 
 
 		 738 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  30.56 
 
 		 762 aa  325  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>