More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1898 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  53.29 
 
 
767 aa  796    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  100 
 
 
742 aa  1476    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  52.13 
 
 
770 aa  798    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  54.92 
 
 
741 aa  799    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43 
 
 
736 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  41.14 
 
 
744 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  41.5 
 
 
744 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  39.86 
 
 
714 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  39.86 
 
 
714 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  40.91 
 
 
740 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  40.06 
 
 
724 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  39.92 
 
 
724 aa  459  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  34.89 
 
 
741 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  34.2 
 
 
739 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  36.82 
 
 
700 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  34.08 
 
 
731 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  33.24 
 
 
728 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.04 
 
 
720 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  33.99 
 
 
724 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  33.99 
 
 
724 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  33.1 
 
 
728 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  34.57 
 
 
712 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.21 
 
 
699 aa  359  8e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  33.58 
 
 
726 aa  356  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.81 
 
 
725 aa  355  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  31.75 
 
 
721 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  32.44 
 
 
706 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  33.04 
 
 
705 aa  351  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  32.55 
 
 
743 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  33.62 
 
 
750 aa  350  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.33 
 
 
865 aa  349  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 
892 aa  347  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 
720 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  33.18 
 
 
726 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  34.97 
 
 
720 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  32.68 
 
 
720 aa  340  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  33.38 
 
 
714 aa  337  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.77 
 
 
753 aa  334  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.57 
 
 
717 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.3 
 
 
731 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.23 
 
 
976 aa  320  7e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.58 
 
 
1024 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  31.06 
 
 
712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  31.06 
 
 
712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.63 
 
 
1038 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.38 
 
 
971 aa  306  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  31.47 
 
 
715 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.66 
 
 
968 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  32.16 
 
 
930 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 
1038 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.81 
 
 
1019 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  30.92 
 
 
712 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.76 
 
 
739 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.51 
 
 
1003 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.85 
 
 
715 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.46 
 
 
999 aa  304  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 
906 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.07 
 
 
906 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
1000 aa  302  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.02 
 
 
1013 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.94 
 
 
1008 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.94 
 
 
1008 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.05 
 
 
975 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.86 
 
 
908 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.12 
 
 
1001 aa  297  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  32.06 
 
 
719 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.11 
 
 
908 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.15 
 
 
1040 aa  294  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  35.6 
 
 
523 aa  294  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.14 
 
 
1016 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  29.27 
 
 
760 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  32.21 
 
 
1042 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.76 
 
 
1013 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  29.12 
 
 
730 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  29.81 
 
 
762 aa  291  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.58 
 
 
1012 aa  289  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.39 
 
 
727 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.54 
 
 
727 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.4 
 
 
986 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.07 
 
 
717 aa  284  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.95 
 
 
980 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  27.79 
 
 
721 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.56 
 
 
1011 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.03 
 
 
734 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.88 
 
 
734 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.09 
 
 
1018 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  29.32 
 
 
737 aa  273  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.28 
 
 
1018 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  29.04 
 
 
734 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.35 
 
 
731 aa  271  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
1006 aa  270  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.47 
 
 
759 aa  270  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  40.23 
 
 
368 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.02 
 
 
1018 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.92 
 
 
726 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  27.95 
 
 
704 aa  264  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  27.73 
 
 
704 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  28.15 
 
 
740 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  29.19 
 
 
590 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 
718 aa  260  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>