More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06455 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  50.54 
 
 
720 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.92 
 
 
715 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  100 
 
 
714 aa  1453    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  52.77 
 
 
715 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  49.68 
 
 
731 aa  625  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  48.5 
 
 
731 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  48.59 
 
 
705 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  49.34 
 
 
728 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  49.12 
 
 
720 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  46.59 
 
 
728 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  49.44 
 
 
720 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  46.56 
 
 
725 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  48.17 
 
 
750 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  51.5 
 
 
753 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  46.03 
 
 
712 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  43.54 
 
 
743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  46.55 
 
 
726 aa  575  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  45.16 
 
 
706 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  46.68 
 
 
721 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  45.79 
 
 
739 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  45.22 
 
 
741 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.38 
 
 
739 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  46.6 
 
 
720 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  41.81 
 
 
724 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  41.81 
 
 
724 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.87 
 
 
717 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  41.31 
 
 
700 aa  528  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  39.91 
 
 
699 aa  524  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  48.68 
 
 
726 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  43.09 
 
 
892 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.72 
 
 
865 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  39.97 
 
 
712 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  39.97 
 
 
712 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  39.81 
 
 
712 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  44.06 
 
 
719 aa  478  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  42.64 
 
 
740 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.51 
 
 
1003 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  41.16 
 
 
714 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  41.65 
 
 
714 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.24 
 
 
1024 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  58.7 
 
 
368 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.55 
 
 
1008 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  44.4 
 
 
523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.55 
 
 
1008 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  39.23 
 
 
1001 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  38.32 
 
 
906 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  40.52 
 
 
976 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.47 
 
 
906 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  40.62 
 
 
971 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  40.07 
 
 
930 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  40.66 
 
 
975 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.44 
 
 
999 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.67 
 
 
908 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.69 
 
 
1000 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  36.9 
 
 
1038 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  36.9 
 
 
1038 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  36.06 
 
 
968 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  36.39 
 
 
908 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.59 
 
 
1013 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  36.63 
 
 
744 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.38 
 
 
1013 aa  419  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.38 
 
 
736 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  36.71 
 
 
980 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.07 
 
 
1019 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.72 
 
 
1016 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  35.8 
 
 
744 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.2 
 
 
1012 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.1 
 
 
1006 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  35.98 
 
 
982 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  37.39 
 
 
986 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  36.48 
 
 
1011 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  37.52 
 
 
740 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  38.06 
 
 
724 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  38.06 
 
 
724 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  38.92 
 
 
730 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  36.38 
 
 
1040 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.07 
 
 
770 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  34.8 
 
 
1042 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.22 
 
 
738 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.31 
 
 
1018 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.09 
 
 
1018 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  35.63 
 
 
741 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  33.44 
 
 
767 aa  363  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.23 
 
 
1018 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  33.38 
 
 
742 aa  361  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  35.21 
 
 
727 aa  359  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  32.94 
 
 
734 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  33.69 
 
 
727 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.03 
 
 
717 aa  337  5e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.49 
 
 
759 aa  336  7e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.31 
 
 
718 aa  334  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.46 
 
 
718 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  31.62 
 
 
737 aa  330  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  32.26 
 
 
734 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.9 
 
 
731 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  32.26 
 
 
734 aa  326  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.45 
 
 
726 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.79 
 
 
578 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.79 
 
 
578 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  32.26 
 
 
721 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>