More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6494 on replicon NC_010502
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  51.29 
 
 
726 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  49.37 
 
 
731 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  52.93 
 
 
725 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  59.92 
 
 
739 aa  876    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  58.88 
 
 
720 aa  677    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  51.49 
 
 
705 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  49.86 
 
 
720 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  49.14 
 
 
706 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  60.03 
 
 
741 aa  880    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  69 
 
 
720 aa  1012    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.73 
 
 
717 aa  992    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  50.35 
 
 
750 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  100 
 
 
721 aa  1450    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  59.05 
 
 
720 aa  678    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  51.64 
 
 
712 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  52.46 
 
 
753 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  68.7 
 
 
726 aa  950    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  51.63 
 
 
731 aa  701    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  50.77 
 
 
743 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  50.7 
 
 
728 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  51.12 
 
 
728 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  52.36 
 
 
739 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  43.14 
 
 
700 aa  597  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  45.29 
 
 
724 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  45.29 
 
 
724 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.59 
 
 
699 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  43.12 
 
 
712 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  43.12 
 
 
712 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  42.98 
 
 
712 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  40.23 
 
 
719 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.47 
 
 
865 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  40.17 
 
 
892 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  40.59 
 
 
714 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.85 
 
 
1024 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  46.68 
 
 
714 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.47 
 
 
1003 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  45.12 
 
 
971 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.77 
 
 
1008 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  40.03 
 
 
980 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.77 
 
 
1008 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  43.01 
 
 
976 aa  505  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.6 
 
 
1001 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  39.89 
 
 
714 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.63 
 
 
1000 aa  502  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.8 
 
 
1013 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  39.35 
 
 
740 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.74 
 
 
1016 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.4 
 
 
715 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  39.87 
 
 
930 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.12 
 
 
1012 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  46.22 
 
 
715 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  47.56 
 
 
523 aa  482  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  41.77 
 
 
975 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  39.16 
 
 
986 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  38.6 
 
 
906 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
906 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.89 
 
 
908 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  40.88 
 
 
968 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.03 
 
 
1019 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  38.18 
 
 
1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  38.18 
 
 
1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.81 
 
 
999 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  37.75 
 
 
908 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  38.76 
 
 
724 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  39.41 
 
 
724 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.32 
 
 
1006 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.56 
 
 
1013 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  35.05 
 
 
982 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  36.15 
 
 
1011 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.9 
 
 
1040 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.66 
 
 
1042 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.03 
 
 
736 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.16 
 
 
1018 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.22 
 
 
1018 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.23 
 
 
1018 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  41.12 
 
 
740 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  38.68 
 
 
730 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  34.01 
 
 
744 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  34.03 
 
 
767 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  32.64 
 
 
744 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  34.89 
 
 
741 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  34.42 
 
 
770 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  31.75 
 
 
742 aa  355  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  33.19 
 
 
721 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.59 
 
 
721 aa  346  8.999999999999999e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.84 
 
 
734 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  46.41 
 
 
368 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  31.65 
 
 
718 aa  339  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.87 
 
 
727 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  31.65 
 
 
718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30.57 
 
 
734 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.05 
 
 
717 aa  337  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.64 
 
 
739 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  30.26 
 
 
704 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.27 
 
 
759 aa  332  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  31.09 
 
 
776 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  33.76 
 
 
718 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  28.34 
 
 
738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.38 
 
 
743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.88 
 
 
727 aa  328  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>