More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0658 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  45.14 
 
 		 727 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  49.24 
 
 		 747 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  100 
 
 		 760 aa  1516    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  43.55 
 
 		 734 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  43.55 
 
 		 734 aa  618  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.91 
 
 		 738 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  41.52 
 
 		 739 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  41.56 
 
 		 727 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.93 
 
 		 717 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  38.18 
 
 		 721 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  38.24 
 
 		 759 aa  501  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  37.64 
 
 		 716 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  37.25 
 
 		 716 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  35.96 
 
 		 738 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  37.5 
 
 		 721 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  35.24 
 
 		 722 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.94 
 
 		 1038 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.8 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  33.76 
 
 		 715 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  34.59 
 
 		 908 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.92 
 
 		 1019 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 		 906 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  35.93 
 
 		 906 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.73 
 
 		 1040 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.88 
 
 		 726 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  35 
 
 		 1011 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.24 
 
 		 1013 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.06 
 
 		 908 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.32 
 
 		 1042 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.75 
 
 		 1018 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.08 
 
 		 1018 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.03 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.76 
 
 		 722 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  30.98 
 
 		 736 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.88 
 
 		 730 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  43.05 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  31.24 
 
 		 737 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  32.03 
 
 		 741 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 1000 aa  360  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30 
 
 		 1024 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  30.56 
 
 		 725 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  30.68 
 
 		 716 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.87 
 
 		 724 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.87 
 
 		 724 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.85 
 
 		 865 aa  350  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.92 
 
 		 731 aa  350  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.43 
 
 		 722 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.16 
 
 		 1003 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.35 
 
 		 1008 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.35 
 
 		 1008 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.63 
 
 		 930 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 726 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.08 
 
 		 999 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  33.95 
 
 		 700 aa  342  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.49 
 
 		 726 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32.17 
 
 		 720 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.9 
 
 		 714 aa  338  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 720 aa  336  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.06 
 
 		 699 aa  336  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.73 
 
 		 741 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  30.06 
 
 		 715 aa  334  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.44 
 
 		 976 aa  333  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.95 
 
 		 725 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.23 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 892 aa  331  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.71 
 
 		 1001 aa  331  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  26.83 
 
 		 715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.33 
 
 		 731 aa  330  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.32 
 
 		 1013 aa  330  8e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  32.2 
 
 		 743 aa  330  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  29.97 
 
 		 720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.82 
 
 		 980 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.64 
 
 		 971 aa  327  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.29 
 
 		 720 aa  327  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  30.59 
 
 		 975 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.5 
 
 		 728 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.34 
 
 		 720 aa  319  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 735 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 1006 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  30.03 
 
 		 982 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  29.17 
 
 		 725 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.14 
 
 		 750 aa  318  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.51 
 
 		 732 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  43.65 
 
 		 521 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.46 
 
 		 986 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.52 
 
 		 1016 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.01 
 
 		 721 aa  317  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  30.45 
 
 		 695 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.23 
 
 		 712 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.88 
 
 		 727 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 728 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  29.27 
 
 		 727 aa  313  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.62 
 
 		 597 aa  313  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  28.67 
 
 		 723 aa  312  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  27.91 
 
 		 740 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.67 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  28.29 
 
 		 714 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.1 
 
 		 1012 aa  312  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>