More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3347 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  100 
 
 		 721 aa  1467    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  58.71 
 
 		 716 aa  911    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  63.13 
 
 		 738 aa  968    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  41.36 
 
 		 734 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  41.36 
 
 		 734 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.86 
 
 		 738 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  39.8 
 
 		 727 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  39.61 
 
 		 727 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  39.78 
 
 		 739 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  37.5 
 
 		 760 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.3 
 
 		 717 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  37.15 
 
 		 721 aa  444  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.81 
 
 		 759 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  36.02 
 
 		 906 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  35.88 
 
 		 906 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  36 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.56 
 
 		 1019 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.13 
 
 		 1040 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.39 
 
 		 908 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.13 
 
 		 1018 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  33.85 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  34.75 
 
 		 908 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.13 
 
 		 1013 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.7 
 
 		 1011 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  33.86 
 
 		 716 aa  409  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.58 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 		 1038 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  33.9 
 
 		 722 aa  396  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.29 
 
 		 1042 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  32.21 
 
 		 715 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.77 
 
 		 731 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.94 
 
 		 1003 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.66 
 
 		 720 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.92 
 
 		 865 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.43 
 
 		 725 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  33.52 
 
 		 716 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 1000 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  33.61 
 
 		 728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.55 
 
 		 892 aa  357  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  33.75 
 
 		 728 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.22 
 
 		 1024 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.58 
 
 		 976 aa  355  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.57 
 
 		 1001 aa  355  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  33.7 
 
 		 743 aa  353  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  31.14 
 
 		 724 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  31.14 
 
 		 724 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  32.03 
 
 		 725 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  31.79 
 
 		 750 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.07 
 
 		 1008 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.07 
 
 		 1008 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  31.78 
 
 		 736 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  32.44 
 
 		 930 aa  347  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.19 
 
 		 999 aa  346  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  33.48 
 
 		 706 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  32 
 
 		 731 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  32.3 
 
 		 968 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  30.54 
 
 		 737 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  34.36 
 
 		 700 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.3 
 
 		 971 aa  341  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.87 
 
 		 753 aa  340  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.12 
 
 		 726 aa  340  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  32.38 
 
 		 975 aa  339  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.44 
 
 		 705 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.03 
 
 		 722 aa  337  5.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 726 aa  336  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  34.08 
 
 		 982 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  32.71 
 
 		 980 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.96 
 
 		 726 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.45 
 
 		 1013 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  31.61 
 
 		 730 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  31.08 
 
 		 986 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.94 
 
 		 1016 aa  328  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  33.49 
 
 		 720 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  35.32 
 
 		 699 aa  327  7e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  31.62 
 
 		 712 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  30.99 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  32.15 
 
 		 719 aa  324  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  31.48 
 
 		 712 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  30.71 
 
 		 722 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  40.75 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  31.1 
 
 		 695 aa  321  3.9999999999999996e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.28 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.87 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.66 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  30.28 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 1006 aa  318  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  31.34 
 
 		 712 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  30.99 
 
 		 715 aa  316  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  30.07 
 
 		 714 aa  316  9e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 704 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  31.18 
 
 		 704 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  31.18 
 
 		 704 aa  314  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.78 
 
 		 1012 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.66 
 
 		 721 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 728 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.73 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  30 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>