More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0339 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 695 aa  1353    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  31.1 
 
 		 721 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 906 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 906 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.99 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.33 
 
 		 717 aa  339  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.65 
 
 		 738 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.66 
 
 		 1019 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29 
 
 		 727 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.37 
 
 		 908 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  32.27 
 
 		 722 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.78 
 
 		 908 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.75 
 
 		 1013 aa  317  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 1038 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.96 
 
 		 1040 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  30.04 
 
 		 1011 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 1038 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  32.04 
 
 		 715 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.68 
 
 		 716 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.98 
 
 		 1018 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  31.85 
 
 		 733 aa  310  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  27.54 
 
 		 716 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  29.04 
 
 		 714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.83 
 
 		 727 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.32 
 
 		 1042 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.26 
 
 		 738 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.15 
 
 		 1018 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.96 
 
 		 736 aa  299  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.15 
 
 		 1018 aa  300  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  29.78 
 
 		 722 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.84 
 
 		 734 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.55 
 
 		 734 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  29.83 
 
 		 721 aa  293  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.1 
 
 		 760 aa  293  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 		 704 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  29.94 
 
 		 704 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  29.94 
 
 		 704 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  28.49 
 
 		 695 aa  290  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.81 
 
 		 705 aa  290  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  26.92 
 
 		 747 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  27.74 
 
 		 716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  27.08 
 
 		 699 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  28 
 
 		 715 aa  281  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.36 
 
 		 741 aa  281  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.75 
 
 		 741 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.01 
 
 		 722 aa  278  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  31.7 
 
 		 719 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  26.76 
 
 		 725 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.13 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.89 
 
 		 721 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.15 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.01 
 
 		 720 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.2 
 
 		 731 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  31.46 
 
 		 719 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.55 
 
 		 865 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30.78 
 
 		 892 aa  270  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.75 
 
 		 1008 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.75 
 
 		 1008 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  30.64 
 
 		 706 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  30.78 
 
 		 706 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  30.78 
 
 		 706 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.4 
 
 		 726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.54 
 
 		 1024 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.67 
 
 		 759 aa  268  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  30.64 
 
 		 706 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.26 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  27.8 
 
 		 721 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.26 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  30.14 
 
 		 723 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  30.14 
 
 		 723 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.06 
 
 		 700 aa  263  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.47 
 
 		 725 aa  263  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  30.03 
 
 		 739 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  27.77 
 
 		 726 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.14 
 
 		 720 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 743 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.16 
 
 		 1013 aa  258  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.07 
 
 		 750 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.94 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 918 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.53 
 
 		 699 aa  253  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  31.03 
 
 		 707 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.59 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.78 
 
 		 726 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.58 
 
 		 724 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 753 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  29.91 
 
 		 734 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.2 
 
 		 986 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 707 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.26 
 
 		 772 aa  247  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.39 
 
 		 731 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 753 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.26 
 
 		 753 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 753 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 753 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 		 753 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.9 
 
 		 971 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  30.17 
 
 		 711 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 		 720 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.32 
 
 		 1001 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>