More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_A02 on replicon NC_008503
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  100 
 
 
716 aa  1442    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  47.08 
 
 
715 aa  659    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  45.98 
 
 
722 aa  639    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  44.76 
 
 
739 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  43.85 
 
 
738 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  40.95 
 
 
727 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  40.84 
 
 
734 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  40.7 
 
 
734 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.02 
 
 
717 aa  503  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  39.53 
 
 
727 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  37.55 
 
 
747 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  37.64 
 
 
760 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  36.63 
 
 
721 aa  471  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.8 
 
 
759 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  35.28 
 
 
1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 
1038 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  34.26 
 
 
738 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  33.86 
 
 
721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.61 
 
 
1040 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  33.61 
 
 
716 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.36 
 
 
1019 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.41 
 
 
908 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 
906 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.78 
 
 
1013 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.47 
 
 
906 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.7 
 
 
1042 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.89 
 
 
1011 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.83 
 
 
1018 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.41 
 
 
1018 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.97 
 
 
1018 aa  364  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.47 
 
 
908 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  45.18 
 
 
455 aa  352  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.56 
 
 
731 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  32.11 
 
 
730 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.24 
 
 
725 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.54 
 
 
722 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  30.58 
 
 
722 aa  333  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.87 
 
 
865 aa  333  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  30.85 
 
 
737 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  29.83 
 
 
736 aa  332  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.07 
 
 
726 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.39 
 
 
741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  32.57 
 
 
700 aa  325  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 
739 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  29.86 
 
 
715 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
724 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.61 
 
 
741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
724 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.67 
 
 
1008 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.67 
 
 
1008 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.81 
 
 
720 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  33.54 
 
 
699 aa  319  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 
892 aa  316  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  30.03 
 
 
753 aa  313  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.13 
 
 
1024 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  29.99 
 
 
1717 aa  310  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.4 
 
 
743 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.73 
 
 
716 aa  308  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.79 
 
 
731 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 
720 aa  306  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.89 
 
 
748 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.59 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  30.24 
 
 
714 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
1000 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  31.62 
 
 
720 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.25 
 
 
721 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  27.73 
 
 
738 aa  303  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.7 
 
 
720 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  28.73 
 
 
727 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  33.22 
 
 
720 aa  302  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  30.41 
 
 
728 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.52 
 
 
725 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  27.64 
 
 
728 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.3 
 
 
705 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.49 
 
 
727 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.24 
 
 
743 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.69 
 
 
986 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.91 
 
 
721 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.42 
 
 
728 aa  297  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.79 
 
 
976 aa  296  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  28.63 
 
 
725 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  43.9 
 
 
521 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  30.65 
 
 
982 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.55 
 
 
721 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.83 
 
 
717 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  27.75 
 
 
1675 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.95 
 
 
975 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 
750 aa  288  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  27.62 
 
 
724 aa  287  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.26 
 
 
930 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  29.71 
 
 
802 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 
712 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.34 
 
 
1003 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.31 
 
 
971 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  27.95 
 
 
726 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  27.75 
 
 
734 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  32.87 
 
 
968 aa  282  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.75 
 
 
1001 aa  281  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  26.86 
 
 
733 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  28 
 
 
724 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>