More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1133 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  51.12 
 
 
715 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  55.76 
 
 
722 aa  821    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  54.33 
 
 
716 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  53.86 
 
 
722 aa  801    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  100 
 
 
714 aa  1457    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  53.58 
 
 
736 aa  820    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  33.52 
 
 
727 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.09 
 
 
1038 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.81 
 
 
1038 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.34 
 
 
1019 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.14 
 
 
738 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.33 
 
 
908 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  30.41 
 
 
1042 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.53 
 
 
1040 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 
906 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
906 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.01 
 
 
908 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.1 
 
 
727 aa  360  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.45 
 
 
1013 aa  359  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  32.32 
 
 
738 aa  356  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.48 
 
 
1011 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.55 
 
 
1018 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  29.2 
 
 
725 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.23 
 
 
734 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  29.78 
 
 
760 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.94 
 
 
734 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.4 
 
 
1018 aa  341  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.08 
 
 
739 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.26 
 
 
1018 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.41 
 
 
759 aa  332  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.49 
 
 
721 aa  331  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  29.69 
 
 
747 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  29.6 
 
 
716 aa  329  9e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  29.1 
 
 
730 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.07 
 
 
721 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.89 
 
 
1024 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.79 
 
 
741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.74 
 
 
717 aa  321  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.62 
 
 
892 aa  317  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.07 
 
 
1008 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.07 
 
 
1008 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  30.24 
 
 
716 aa  316  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.67 
 
 
865 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  29.34 
 
 
715 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.06 
 
 
728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.25 
 
 
722 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.63 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.04 
 
 
743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.15 
 
 
1000 aa  302  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  27.43 
 
 
726 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  29.69 
 
 
726 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  29.04 
 
 
695 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.3 
 
 
725 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.92 
 
 
731 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.51 
 
 
741 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
743 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.31 
 
 
999 aa  293  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.65 
 
 
739 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.24 
 
 
971 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.24 
 
 
720 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.78 
 
 
1003 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.39 
 
 
1013 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.07 
 
 
976 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.19 
 
 
750 aa  286  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.44 
 
 
699 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.41 
 
 
724 aa  283  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 
721 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.39 
 
 
728 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  26.22 
 
 
737 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  27.37 
 
 
986 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.62 
 
 
930 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.67 
 
 
731 aa  280  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  26.72 
 
 
773 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.17 
 
 
733 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  28.77 
 
 
719 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  27.48 
 
 
735 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.09 
 
 
1016 aa  278  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  28.53 
 
 
720 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 
720 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.39 
 
 
737 aa  276  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.9 
 
 
1006 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  30.87 
 
 
720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  26.49 
 
 
802 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.63 
 
 
726 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.02 
 
 
1012 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.26 
 
 
724 aa  270  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.26 
 
 
724 aa  270  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.67 
 
 
721 aa  270  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  29.01 
 
 
724 aa  266  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  27.62 
 
 
712 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  28.23 
 
 
714 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.89 
 
 
712 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.89 
 
 
712 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.08 
 
 
739 aa  264  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  28.04 
 
 
712 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  28.65 
 
 
719 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  26.47 
 
 
771 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  27.71 
 
 
726 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  27.99 
 
 
975 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  28.74 
 
 
712 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>