More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4506 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  45.92 
 
 		 699 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  100 
 
 		 721 aa  1483    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  65.91 
 
 		 725 aa  979    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  47.26 
 
 		 726 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  44.32 
 
 		 733 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  48.4 
 
 		 695 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  43.4 
 
 		 719 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  42.98 
 
 		 719 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  44.51 
 
 		 712 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 753 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  43.04 
 
 		 723 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  43.04 
 
 		 723 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.7 
 
 		 753 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  43.84 
 
 		 772 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 753 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 753 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  45.98 
 
 		 688 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 753 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 753 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  42.49 
 
 		 739 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  43.76 
 
 		 767 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.55 
 
 		 770 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  44.9 
 
 		 707 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 707 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  44.75 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  45.72 
 
 		 719 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  43.1 
 
 		 724 aa  602  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  41.93 
 
 		 714 aa  595  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  40.29 
 
 		 719 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  44.19 
 
 		 696 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  41.98 
 
 		 726 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  42.65 
 
 		 704 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.65 
 
 		 704 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  42.65 
 
 		 704 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  40.97 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  40.97 
 
 		 723 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  40.83 
 
 		 723 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  41.19 
 
 		 683 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 		 711 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  34.04 
 
 		 706 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  33.9 
 
 		 706 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  33.9 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  33.9 
 
 		 706 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.52 
 
 		 707 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 707 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 707 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 707 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 707 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  32.1 
 
 		 707 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 707 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  31.47 
 
 		 707 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.29 
 
 		 1019 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 		 1038 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.54 
 
 		 1040 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.68 
 
 		 1038 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.77 
 
 		 1042 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.39 
 
 		 726 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.97 
 
 		 1018 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  30.74 
 
 		 906 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  30.74 
 
 		 906 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.1 
 
 		 1018 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.61 
 
 		 743 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.95 
 
 		 721 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.53 
 
 		 1018 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.2 
 
 		 1013 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.69 
 
 		 908 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.33 
 
 		 727 aa  329  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.04 
 
 		 720 aa  328  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.76 
 
 		 727 aa  328  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  29.14 
 
 		 1011 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.11 
 
 		 908 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  30.36 
 
 		 706 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  28.35 
 
 		 727 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.55 
 
 		 728 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  28.57 
 
 		 725 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.16 
 
 		 728 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.61 
 
 		 700 aa  313  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  29.64 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.32 
 
 		 738 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.67 
 
 		 750 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.94 
 
 		 727 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.49 
 
 		 721 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  29.4 
 
 		 748 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.26 
 
 		 739 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.21 
 
 		 741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.97 
 
 		 980 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.1 
 
 		 737 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  27.48 
 
 		 725 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.49 
 
 		 865 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  27.93 
 
 		 725 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.01 
 
 		 724 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.01 
 
 		 724 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 892 aa  302  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28 
 
 		 734 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.12 
 
 		 1000 aa  301  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.73 
 
 		 715 aa  300  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.22 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.86 
 
 		 734 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.63 
 
 		 1013 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>