More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3454 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  78.93 
 
 		 705 aa  1156    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  100 
 
 		 706 aa  1440    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  31.02 
 
 		 706 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  31.02 
 
 		 706 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  31.02 
 
 		 706 aa  336  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  30.74 
 
 		 706 aa  336  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  30.36 
 
 		 721 aa  331  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.09 
 
 		 707 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.09 
 
 		 707 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  29.94 
 
 		 707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.94 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.94 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.94 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.58 
 
 		 707 aa  327  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  29.38 
 
 		 725 aa  312  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  29.03 
 
 		 695 aa  306  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  30.1 
 
 		 719 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  30.56 
 
 		 714 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.84 
 
 		 699 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  29.52 
 
 		 712 aa  296  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  27.88 
 
 		 733 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  28.39 
 
 		 726 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.63 
 
 		 724 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30 
 
 		 707 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  29.94 
 
 		 719 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.86 
 
 		 707 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  31.16 
 
 		 767 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  28.93 
 
 		 726 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  27.49 
 
 		 704 aa  285  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.49 
 
 		 704 aa  284  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  29.6 
 
 		 704 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  27.49 
 
 		 704 aa  284  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 753 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.06 
 
 		 772 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.49 
 
 		 719 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.06 
 
 		 753 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 753 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 753 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 753 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 753 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  29.06 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  28.93 
 
 		 688 aa  273  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.61 
 
 		 770 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  28.88 
 
 		 723 aa  270  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  29.26 
 
 		 696 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  29.02 
 
 		 723 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.59 
 
 		 683 aa  267  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.55 
 
 		 719 aa  259  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  29.41 
 
 		 723 aa  258  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  27.68 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  27.68 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  28.22 
 
 		 918 aa  253  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  26.55 
 
 		 726 aa  250  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  28.86 
 
 		 720 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  28.47 
 
 		 707 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  27.95 
 
 		 711 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  27.79 
 
 		 743 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  25.07 
 
 		 737 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.91 
 
 		 721 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  29.12 
 
 		 695 aa  216  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  25.46 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.1 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27 
 
 		 1019 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  25.43 
 
 		 727 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  25.1 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 		 1038 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 1038 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.35 
 
 		 738 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.25 
 
 		 715 aa  204  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.43 
 
 		 1040 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  25 
 
 		 734 aa  200  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  24.36 
 
 		 732 aa  200  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  24.5 
 
 		 716 aa  198  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.29 
 
 		 725 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  24.72 
 
 		 734 aa  196  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  24.01 
 
 		 760 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  24.65 
 
 		 721 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  22.56 
 
 		 727 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  25 
 
 		 734 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.5 
 
 		 722 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  25.81 
 
 		 1018 aa  190  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.99 
 
 		 1018 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.68 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  23.19 
 
 		 715 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.53 
 
 		 1018 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  26.35 
 
 		 930 aa  185  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  25.28 
 
 		 738 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  26.69 
 
 		 731 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  25.21 
 
 		 1675 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  23.7 
 
 		 736 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  24.56 
 
 		 722 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  24.44 
 
 		 1042 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  26.01 
 
 		 715 aa  181  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  25.77 
 
 		 716 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.96 
 
 		 1013 aa  180  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 		 906 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  25.37 
 
 		 1011 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  24.68 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  24.48 
 
 		 730 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  23.5 
 
 		 725 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>