More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0781 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  59.33 
 
 		 728 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 771 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  52.34 
 
 		 730 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  51.87 
 
 		 726 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  54.87 
 
 		 773 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  53.27 
 
 		 735 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0781  ABC transporter related protein  100 
 
 		 827 aa  1699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  56.67 
 
 		 725 aa  781    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  55.83 
 
 		 802 aa  921    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  50.6 
 
 		 741 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  45.67 
 
 		 737 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  38.83 
 
 		 735 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.33 
 
 		 1040 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.08 
 
 		 1018 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  33.74 
 
 		 1038 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.74 
 
 		 1038 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.44 
 
 		 1018 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.44 
 
 		 1018 aa  312  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  27.98 
 
 		 739 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 906 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 906 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.09 
 
 		 727 aa  297  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.76 
 
 		 1019 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.47 
 
 		 1042 aa  294  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.64 
 
 		 734 aa  293  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.38 
 
 		 1011 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.66 
 
 		 1024 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 1000 aa  289  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.01 
 
 		 908 aa  290  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.55 
 
 		 734 aa  289  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.34 
 
 		 724 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.34 
 
 		 724 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  32.34 
 
 		 721 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.09 
 
 		 986 aa  283  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.24 
 
 		 999 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.19 
 
 		 865 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.82 
 
 		 976 aa  282  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.75 
 
 		 738 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  30.68 
 
 		 699 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.28 
 
 		 908 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  28.57 
 
 		 930 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.97 
 
 		 1003 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32.66 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  25.88 
 
 		 760 aa  275  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 		 720 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.99 
 
 		 727 aa  274  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.46 
 
 		 1008 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.46 
 
 		 1008 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.77 
 
 		 1013 aa  272  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.8 
 
 		 700 aa  271  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.46 
 
 		 739 aa  271  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.49 
 
 		 1013 aa  270  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.55 
 
 		 971 aa  270  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.38 
 
 		 759 aa  268  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  32.17 
 
 		 726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  33.77 
 
 		 712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.12 
 
 		 720 aa  268  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.63 
 
 		 725 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 892 aa  267  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.41 
 
 		 741 aa  267  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.87 
 
 		 980 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.57 
 
 		 720 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  31.09 
 
 		 706 aa  263  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  30.91 
 
 		 720 aa  263  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.34 
 
 		 731 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  31.61 
 
 		 975 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.77 
 
 		 728 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.51 
 
 		 753 aa  260  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.03 
 
 		 738 aa  260  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  24.57 
 
 		 721 aa  258  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  30.95 
 
 		 968 aa  258  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27 
 
 		 1016 aa  258  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.85 
 
 		 728 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  30.82 
 
 		 712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.39 
 
 		 722 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  30.82 
 
 		 712 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.01 
 
 		 1001 aa  253  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  29.52 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.02 
 
 		 739 aa  251  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.56 
 
 		 705 aa  251  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.51 
 
 		 750 aa  251  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  30.65 
 
 		 712 aa  250  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.19 
 
 		 717 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.08 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  29.8 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  26.13 
 
 		 747 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  27.99 
 
 		 714 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  27.86 
 
 		 740 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.47 
 
 		 1012 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.03 
 
 		 731 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  27.68 
 
 		 714 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30.46 
 
 		 721 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  26.17 
 
 		 715 aa  244  6e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  28.51 
 
 		 721 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  25.55 
 
 		 716 aa  243  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.73 
 
 		 716 aa  240  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  26.96 
 
 		 704 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  30.9 
 
 		 719 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29 
 
 		 1006 aa  237  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>