More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4169 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.14 
 
 		 599 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.66 
 
 		 597 aa  723    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.7 
 
 		 583 aa  889    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  98.13 
 
 		 587 aa  1167    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.93 
 
 		 597 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 587 aa  1184    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.36 
 
 		 585 aa  911    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.62 
 
 		 595 aa  704    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.62 
 
 		 604 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.06 
 
 		 626 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.56 
 
 		 599 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.01 
 
 		 593 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.1 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.31 
 
 		 599 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.55 
 
 		 602 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.75 
 
 		 602 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.32 
 
 		 591 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.38 
 
 		 595 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.14 
 
 		 600 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.03 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.61 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.08 
 
 		 590 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.91 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  36.33 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.82 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.46 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.09 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.97 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.49 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.63 
 
 		 572 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  30.8 
 
 		 613 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  33 
 
 		 617 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.38 
 
 		 468 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.4 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  31.39 
 
 		 628 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.74 
 
 		 596 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  35.46 
 
 		 626 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.79 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  29.32 
 
 		 582 aa  263  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 		 628 aa  263  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.02 
 
 		 597 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.07 
 
 		 614 aa  263  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.16 
 
 		 603 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 603 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.41 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 598 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  41.18 
 
 		 625 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.16 
 
 		 625 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  37.06 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  30.64 
 
 		 625 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  32.56 
 
 		 584 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.33 
 
 		 617 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 1000 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  33.97 
 
 		 615 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  37.25 
 
 		 613 aa  259  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.1 
 
 		 574 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  31.74 
 
 		 620 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  29.02 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.28 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.9 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  36.5 
 
 		 770 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  40.91 
 
 		 625 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.42 
 
 		 566 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.39 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  36.28 
 
 		 750 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  32.68 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.77 
 
 		 625 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  33.39 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.03 
 
 		 597 aa  257  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 		 637 aa  257  5e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.66 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.03 
 
 		 597 aa  256  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 		 589 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  33.98 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34 
 
 		 628 aa  256  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 592 aa  256  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.3 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  35.29 
 
 		 663 aa  256  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.2 
 
 		 597 aa  256  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.66 
 
 		 586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.76 
 
 		 602 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  30.12 
 
 		 624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  30.7 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  33.68 
 
 		 596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  33 
 
 		 606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39 
 
 		 601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.06 
 
 		 593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  39.52 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.32 
 
 		 586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 		 637 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  38.3 
 
 		 621 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  29.3 
 
 		 626 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  32.03 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  36.68 
 
 		 784 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  38.24 
 
 		 765 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>