More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0349 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 
600 aa  1197    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.24 
 
 
594 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.88 
 
 
590 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.11 
 
 
626 aa  679    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.86 
 
 
590 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.01 
 
 
602 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.09 
 
 
591 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  63.84 
 
 
595 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.01 
 
 
604 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.52 
 
 
602 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.28 
 
 
593 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.52 
 
 
590 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.42 
 
 
596 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.83 
 
 
599 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.15 
 
 
599 aa  720    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.37 
 
 
599 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.77 
 
 
597 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.17 
 
 
597 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.98 
 
 
595 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.52 
 
 
585 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.13 
 
 
583 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.66 
 
 
587 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.14 
 
 
587 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.02 
 
 
597 aa  316  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.82 
 
 
584 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.88 
 
 
571 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.88 
 
 
571 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  33.85 
 
 
782 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 
571 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.88 
 
 
571 aa  280  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 
571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.5 
 
 
584 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.02 
 
 
764 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.67 
 
 
571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 
586 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.67 
 
 
571 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.85 
 
 
620 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.51 
 
 
598 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
640 aa  277  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.9 
 
 
597 aa  277  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.25 
 
 
567 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.33 
 
 
571 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.67 
 
 
571 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.67 
 
 
571 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  32.14 
 
 
591 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.04 
 
 
567 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  33.73 
 
 
784 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.92 
 
 
773 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  33.8 
 
 
770 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  35.5 
 
 
652 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  33.8 
 
 
750 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.61 
 
 
764 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.11 
 
 
627 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.2 
 
 
579 aa  273  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.19 
 
 
567 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
586 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  36.17 
 
 
603 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  40.63 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  33.65 
 
 
672 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.41 
 
 
603 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.88 
 
 
572 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.82 
 
 
602 aa  270  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.86 
 
 
586 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.69 
 
 
586 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.69 
 
 
768 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.69 
 
 
586 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  35.54 
 
 
565 aa  269  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  33.59 
 
 
784 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  34 
 
 
726 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.81 
 
 
590 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  38.08 
 
 
572 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
572 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  38.08 
 
 
572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.52 
 
 
586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  34.7 
 
 
582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  32.34 
 
 
784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.37 
 
 
586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  32.01 
 
 
920 aa  267  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
585 aa  267  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  36.52 
 
 
569 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  35.36 
 
 
589 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.13 
 
 
609 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
586 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.69 
 
 
586 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  33.21 
 
 
768 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.89 
 
 
598 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  32.06 
 
 
622 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  33.21 
 
 
814 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  33.27 
 
 
778 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.47 
 
 
597 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.78 
 
 
594 aa  264  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
585 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
764 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  33.2 
 
 
760 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  32.99 
 
 
606 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  35.19 
 
 
640 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.45 
 
 
584 aa  263  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 
572 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  33.33 
 
 
651 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>