More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3142 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.23 
 
 		 599 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.1 
 
 		 597 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.36 
 
 		 587 aa  907    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.17 
 
 		 597 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.45 
 
 		 587 aa  907    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.99 
 
 		 583 aa  914    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  57.76 
 
 		 595 aa  707    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 585 aa  1173    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  45.94 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.81 
 
 		 604 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.23 
 
 		 596 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.46 
 
 		 593 aa  475  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.4 
 
 		 599 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.4 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.44 
 
 		 602 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.37 
 
 		 602 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.52 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.19 
 
 		 591 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.93 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.41 
 
 		 595 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.17 
 
 		 590 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.62 
 
 		 590 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40 
 
 		 590 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  36.73 
 
 		 589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.06 
 
 		 594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.72 
 
 		 597 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.19 
 
 		 468 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.91 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.21 
 
 		 603 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 		 603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  33.5 
 
 		 975 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  34.3 
 
 		 765 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.6 
 
 		 597 aa  266  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.77 
 
 		 578 aa  267  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.77 
 
 		 578 aa  267  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.6 
 
 		 597 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.54 
 
 		 721 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  30.98 
 
 		 613 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.33 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  33.51 
 
 		 569 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.42 
 
 		 613 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.52 
 
 		 584 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.26 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.09 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.75 
 
 		 589 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  35.16 
 
 		 634 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.79 
 
 		 586 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.79 
 
 		 586 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  34.97 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.47 
 
 		 580 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.34 
 
 		 597 aa  260  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  37.75 
 
 		 584 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.62 
 
 		 672 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.45 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.47 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.26 
 
 		 971 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.45 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.2 
 
 		 649 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.28 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.62 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.62 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.23 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.79 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.22 
 
 		 636 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.91 
 
 		 669 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.45 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.92 
 
 		 1024 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.14 
 
 		 631 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.68 
 
 		 640 aa  258  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.9 
 
 		 637 aa  258  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.11 
 
 		 586 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.76 
 
 		 976 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.69 
 
 		 614 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.65 
 
 		 602 aa  256  8e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.47 
 
 		 596 aa  256  9e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  34.83 
 
 		 680 aa  256  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.4 
 
 		 638 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  43.12 
 
 		 666 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  34.78 
 
 		 593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  30.86 
 
 		 620 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 1000 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  30.81 
 
 		 628 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  34.83 
 
 		 691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 661 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  33.05 
 
 		 596 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  36.24 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.9 
 
 		 637 aa  253  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31 
 
 		 598 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  42.13 
 
 		 625 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  32.88 
 
 		 603 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.2 
 
 		 582 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.37 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 591 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  38.87 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>