More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3841 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  98.13 
 
 
587 aa  1167    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.31 
 
 
599 aa  731    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.45 
 
 
597 aa  737    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.83 
 
 
597 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.45 
 
 
585 aa  910    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.7 
 
 
583 aa  891    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 
587 aa  1182    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  57.59 
 
 
595 aa  697    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.62 
 
 
604 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.91 
 
 
599 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.06 
 
 
626 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.01 
 
 
593 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.19 
 
 
596 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.97 
 
 
599 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.72 
 
 
602 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.9 
 
 
595 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.58 
 
 
602 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.42 
 
 
591 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.72 
 
 
594 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.66 
 
 
600 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.13 
 
 
590 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.59 
 
 
590 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.42 
 
 
590 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
598 aa  287  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  37.5 
 
 
579 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  36.53 
 
 
589 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.25 
 
 
580 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.19 
 
 
584 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  29.91 
 
 
594 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  29.93 
 
 
613 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.01 
 
 
596 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  31.39 
 
 
628 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.28 
 
 
572 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
575 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.14 
 
 
597 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  33.17 
 
 
617 aa  270  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.33 
 
 
582 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  35.3 
 
 
626 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.29 
 
 
468 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.24 
 
 
640 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.79 
 
 
588 aa  267  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.59 
 
 
614 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.69 
 
 
617 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.6 
 
 
566 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.23 
 
 
597 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.91 
 
 
608 aa  263  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  30.65 
 
 
625 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
1000 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.6 
 
 
566 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.56 
 
 
597 aa  263  8e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.56 
 
 
597 aa  263  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  32.77 
 
 
584 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  30.81 
 
 
624 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.98 
 
 
628 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  34.55 
 
 
615 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.35 
 
 
586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.16 
 
 
603 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  33.57 
 
 
646 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.64 
 
 
598 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.82 
 
 
584 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 
603 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.31 
 
 
574 aa  261  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.98 
 
 
625 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.35 
 
 
586 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.47 
 
 
582 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.28 
 
 
608 aa  260  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.44 
 
 
597 aa  259  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 
589 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.1 
 
 
574 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.18 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.66 
 
 
586 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.1 
 
 
602 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.2 
 
 
649 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  37.02 
 
 
613 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.74 
 
 
579 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  31.05 
 
 
608 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  37.04 
 
 
613 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  40.64 
 
 
625 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.23 
 
 
593 aa  258  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.01 
 
 
586 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.66 
 
 
586 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 
586 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  33.68 
 
 
596 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  31.86 
 
 
584 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  29.02 
 
 
636 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  31.91 
 
 
616 aa  256  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.16 
 
 
582 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  35.29 
 
 
663 aa  256  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  37.59 
 
 
602 aa  256  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  33.98 
 
 
569 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  33.56 
 
 
652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  38.5 
 
 
765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  33 
 
 
606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
637 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.8 
 
 
625 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.7 
 
 
770 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.36 
 
 
601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.91 
 
 
618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>