More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4373 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.59 
 
 		 599 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.7 
 
 		 587 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.99 
 
 		 585 aa  913    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.7 
 
 		 587 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.11 
 
 		 597 aa  729    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 583 aa  1169    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.63 
 
 		 597 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  57.87 
 
 		 595 aa  683    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.91 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.44 
 
 		 604 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.4 
 
 		 599 aa  465  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.88 
 
 		 599 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.13 
 
 		 600 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.55 
 
 		 593 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.24 
 
 		 626 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.11 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.4 
 
 		 602 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.52 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.73 
 
 		 595 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.74 
 
 		 590 aa  412  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.57 
 
 		 590 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  38.74 
 
 		 590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.76 
 
 		 597 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  35.99 
 
 		 589 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.97 
 
 		 594 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.5 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  30.76 
 
 		 613 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.87 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 575 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.81 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  35.03 
 
 		 589 aa  270  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.1 
 
 		 603 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  31.28 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  30.86 
 
 		 628 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  32.82 
 
 		 672 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  36.26 
 
 		 468 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.12 
 
 		 588 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  31.89 
 
 		 603 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  35.78 
 
 		 663 aa  263  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  32.4 
 
 		 603 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.88 
 
 		 578 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.73 
 
 		 628 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.88 
 
 		 578 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.93 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.03 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.58 
 
 		 600 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.2 
 
 		 601 aa  261  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  33.9 
 
 		 644 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  31.18 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  30.6 
 
 		 603 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.74 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.18 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.92 
 
 		 578 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  30.52 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 		 652 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  35.56 
 
 		 613 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  32.71 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  33.5 
 
 		 975 aa  257  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 1000 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  31.25 
 
 		 584 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.93 
 
 		 596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.52 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  32.16 
 
 		 569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.69 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  34.14 
 
 		 640 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 		 608 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.29 
 
 		 593 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.55 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  32.72 
 
 		 647 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.31 
 
 		 574 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 572 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02570  ABC transporter, putative  30.78 
 
 		 1216 aa  253  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.88 
 
 		 583 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.97 
 
 		 597 aa  253  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  32.67 
 
 		 649 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.47 
 
 		 976 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 572 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  34.81 
 
 		 621 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.72 
 
 		 670 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 935 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.44 
 
 		 607 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 592 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.05 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 650 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  35.2 
 
 		 663 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  32.99 
 
 		 624 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  35.2 
 
 		 662 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.69 
 
 		 625 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  35.86 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.14 
 
 		 602 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  28.6 
 
 		 572 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.43 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.18 
 
 		 764 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  33.45 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.01 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>