More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0954 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  78.57 
 
 		 626 aa  940    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.79 
 
 		 599 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.72 
 
 		 591 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  81.54 
 
 		 599 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  82.22 
 
 		 602 aa  941    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  81.4 
 
 		 604 aa  984    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  84.01 
 
 		 602 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  81.29 
 
 		 593 aa  951    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.48 
 
 		 590 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.42 
 
 		 600 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.82 
 
 		 590 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 596 aa  1192    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.48 
 
 		 590 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  59.33 
 
 		 595 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.1 
 
 		 594 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.31 
 
 		 595 aa  492  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.12 
 
 		 597 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  43.01 
 
 		 599 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.91 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.46 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.19 
 
 		 587 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.91 
 
 		 583 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.1 
 
 		 587 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.24 
 
 		 597 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.81 
 
 		 609 aa  297  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.36 
 
 		 587 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  33.39 
 
 		 638 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.5 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.04 
 
 		 572 aa  290  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  36.51 
 
 		 611 aa  290  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.02 
 
 		 602 aa  290  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  34.21 
 
 		 672 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.14 
 
 		 627 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 575 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.75 
 
 		 764 aa  286  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  33.04 
 
 		 582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  33.63 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.01 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.01 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  34.49 
 
 		 660 aa  283  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 		 603 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  35.38 
 
 		 652 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.7 
 
 		 603 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 622 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.83 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.01 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.1 
 
 		 614 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 639 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.1 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  34.4 
 
 		 655 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.83 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.98 
 
 		 768 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  36.82 
 
 		 569 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.91 
 
 		 671 aa  280  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.12 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.62 
 
 		 597 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.12 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 632 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.38 
 
 		 582 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  32.87 
 
 		 672 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  35.64 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  33.76 
 
 		 784 aa  277  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  33.86 
 
 		 642 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.39 
 
 		 567 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  35.28 
 
 		 640 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  36.05 
 
 		 770 aa  276  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.16 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.03 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.5 
 
 		 622 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.82 
 
 		 644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.92 
 
 		 650 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  36.05 
 
 		 750 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.58 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.33 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  33.95 
 
 		 651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.91 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  35.21 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.9 
 
 		 764 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  35.21 
 
 		 580 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.5 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  35.91 
 
 		 808 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.27 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  31.93 
 
 		 619 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.59 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.76 
 
 		 590 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  34.11 
 
 		 626 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  35.91 
 
 		 782 aa  273  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>