More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02570 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02570  ABC transporter, putative  100 
 
 
1216 aa  2478    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  37.32 
 
 
920 aa  473  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  40.57 
 
 
610 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  39.63 
 
 
612 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.63 
 
 
612 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  39.12 
 
 
655 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.68 
 
 
631 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.68 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  40.68 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  38.89 
 
 
640 aa  416  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  38.05 
 
 
672 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.42 
 
 
628 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  38.7 
 
 
617 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  38.36 
 
 
606 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  38.57 
 
 
647 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  38.42 
 
 
652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  37.9 
 
 
661 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  38.05 
 
 
644 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  38.57 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  38.91 
 
 
625 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  38.57 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
589 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.11 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  38.63 
 
 
651 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  37.56 
 
 
663 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  37.65 
 
 
646 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  37.46 
 
 
662 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 
628 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.46 
 
 
657 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  38.2 
 
 
604 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  39.15 
 
 
622 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  37.75 
 
 
628 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  37.37 
 
 
606 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  38.54 
 
 
607 aa  395  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  37.39 
 
 
651 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  38.58 
 
 
607 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.38 
 
 
627 aa  395  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  40.87 
 
 
612 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  36.84 
 
 
672 aa  392  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  38.64 
 
 
611 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  38.28 
 
 
624 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  36.73 
 
 
652 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  40.87 
 
 
612 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  39.84 
 
 
626 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
593 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  37.35 
 
 
592 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  38.68 
 
 
607 aa  386  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  37.59 
 
 
654 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  39.34 
 
 
623 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  36.85 
 
 
623 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  39.34 
 
 
623 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  36.1 
 
 
721 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  38.83 
 
 
627 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.92 
 
 
629 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
603 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  37.31 
 
 
609 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  38.31 
 
 
605 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  36.33 
 
 
623 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  39.96 
 
 
608 aa  376  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  36.97 
 
 
623 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 
630 aa  376  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
590 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  36.81 
 
 
623 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  37.65 
 
 
893 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.35 
 
 
602 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  39.44 
 
 
606 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36 
 
 
651 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.52 
 
 
656 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  36.61 
 
 
631 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  36.92 
 
 
621 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  36.55 
 
 
595 aa  370  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.98 
 
 
624 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  38.76 
 
 
623 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  37.13 
 
 
615 aa  370  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  34.54 
 
 
625 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2340  ABC transporter related  38.09 
 
 
604 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  38.94 
 
 
629 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28662  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial homolog (ABCB)  37.42 
 
 
654 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  36.02 
 
 
597 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 
619 aa  365  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  35.8 
 
 
591 aa  365  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
591 aa  364  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  38.72 
 
 
598 aa  363  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
596 aa  362  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  38.72 
 
 
596 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  38.51 
 
 
594 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  38.3 
 
 
598 aa  360  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  38.38 
 
 
652 aa  360  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
991 aa  360  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  38.51 
 
 
598 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
981 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  38.51 
 
 
598 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  36.35 
 
 
654 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  38.51 
 
 
598 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  38.06 
 
 
608 aa  358  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  35.74 
 
 
603 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
921 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
933 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 
623 aa  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 
623 aa  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>